Sökning: WFRF:(Rolstad Sindre 1976)
> (2010-2014)
> Komorowski Jan >
Monte Carlo feature...
Monte Carlo feature selection and rule-based models to predict Alzheimer's disease in mild cognitive impairment.
-
- Kruczyk, Marcin (författare)
- Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
-
- Zetterberg, Henrik, 1973 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry
-
- Hansson, Oskar (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Malmö,Medicinska fakulteten,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Department of Clinical Sciences, Malmö,Faculty of Medicine,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups
-
visa fler...
-
- Rolstad, Sindre, 1976 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry
-
- Minthon, Lennart (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups
-
- Wallin, Anders, 1950 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry
-
- Blennow, Kaj, 1958 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry
-
- Komorowski, Jan (författare)
- Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
-
Andersson, Mats Gunnar (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2012-05-10
- 2012
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of neural transmission (Vienna, Austria : 1996). - : Springer Science and Business Media LLC. - 1435-1463 .- 0300-9564. ; 119:7, s. 821-31
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The objective of the present study was to evaluate a Monte Carlo feature selection (MCFS) and rough set Rosetta pipeline for generating rule-based models as a tool for comprehensive risk estimates for future Alzheimer's disease (AD) in individual patients with mild cognitive impairment (MCI). Risk estimates were generated on the basis of age, gender, Mini-Mental State Examination scores, apolipoprotein E (APOE) genotype and the cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers total tau (T-tau), phospho-tau(181) (P-tau) and the 42 amino acid form of amyloid β (Aβ42) in two sets of longitudinally followed MCI patients (n=217 in total). The predictive model was created in Rosetta, evaluated with the standard tenfold cross-validation approach and tested on an external set. Features were ranked and selected by the MCFS algorithm. Using the combined pipeline of MCFS and Rosetta, it was possible to predict AD among patients with MCI with an area under the receiver operating characteristics curve of 0.92. Risk estimates were produced for the individual patients and showed good correlation with actual diagnosis in cross validation, and on an external dataset from a new study. Analysis of the importance of attributes showed that the biochemical CSF markers contributed the most to the predictions, and that added value was gained by combining several biochemical markers. Despite a correlation with the biochemical markers, the genetic marker APOE ε4 did not contribute to the predictive power of the model.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Neurovetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Neurosciences (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Neurologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Neurology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
Nyckelord
- Aged
- Alzheimer Disease
- cerebrospinal fluid
- diagnosis
- psychology
- Amyloid beta-Peptides
- cerebrospinal fluid
- Disease Progression
- Female
- Humans
- Male
- Mild Cognitive Impairment
- cerebrospinal fluid
- psychology
- Monte Carlo Method
- Neuropsychological Tests
- Peptide Fragments
- cerebrospinal fluid
- Phosphorylation
- Predictive Value of Tests
- tau Proteins
- cerebrospinal fluid
- Alzheimer's disease
- Decision support
- Monte Carlo feature selection
- Rosetta
- Rough sets
- Biomarkers
- Cerebrospinal fluid
- Alzheimer's disease
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Kruczyk, Marcin
-
Zetterberg, Henr ...
-
Hansson, Oskar
-
Rolstad, Sindre, ...
-
Minthon, Lennart
-
Wallin, Anders, ...
-
visa fler...
-
Blennow, Kaj, 19 ...
-
Komorowski, Jan
-
Andersson, Mats ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Neurovetenskaper
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Neurologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Bioinformatik
- Artiklar i publikationen
-
Journal of neura ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Lunds universitet
-
Uppsala universitet