Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-140375" >
HiRIEF LC-MSMS enab...
HiRIEF LC-MSMS enables deep proteome coverage and unbiased proteogenomics
-
- Branca, Rui M. M. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Orre, Lukas M. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Johansson, Henrik J. (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa fler...
-
- Granholm, Viktor (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
-
- Huss, Mikael (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
-
Perez-Bercoff, Åsa (författare)
-
- Forshed, Jenny (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Käll, Lukas (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,SeRC - Swedish e-Science Research Centre
-
- Lehtiö, Janne (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2014
- 2014
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Methods. - 1548-7091 .- 1548-7105. ; 11:1, s. 59-
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- We present a liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MSMS)-based method permitting unbiased (gene prediction-independent) genome-wide discovery of protein-coding loci in higher eukaryotes. Using high-resolution isoelectric focusing (HiRIEF) at the peptide level in the 3.7-5.0 pH range and accurate peptide isoelectric point (pI) prediction, we probed the six-reading-frame translation of the human and mouse genomes and identified 98 and 52 previously undiscovered protein-coding loci, respectively. The method also enabled deep proteome coverage, identifying 13,078 human and 10,637 mouse proteins.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Tandem Mass-Spectra
- Peptide Identification
- Human Genome
- Gene
- Fractionation
- Spectrometry
- Pseudogenes
- Annotation
- Landscape
- Dynamics
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas