Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-140375" >
HiRIEF LC-MSMS enab...
-
Branca, Rui M. M.Karolinska Institutet
(författare)
HiRIEF LC-MSMS enables deep proteome coverage and unbiased proteogenomics
- Artikel/kapitelEngelska2014
Förlag, utgivningsår, omfång ...
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-140375
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-140375URI
-
https://doi.org/10.1038/NMETH.2732DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:128003993URI
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-100102URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
QC 20140123
-
AuthorCount:9;
-
We present a liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MSMS)-based method permitting unbiased (gene prediction-independent) genome-wide discovery of protein-coding loci in higher eukaryotes. Using high-resolution isoelectric focusing (HiRIEF) at the peptide level in the 3.7-5.0 pH range and accurate peptide isoelectric point (pI) prediction, we probed the six-reading-frame translation of the human and mouse genomes and identified 98 and 52 previously undiscovered protein-coding loci, respectively. The method also enabled deep proteome coverage, identifying 13,078 human and 10,637 mouse proteins.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Orre, Lukas M.Karolinska Institutet
(författare)
-
Johansson, Henrik J.Karolinska Institutet
(författare)
-
Granholm, ViktorStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)(Swepub:su)vigr7481
(författare)
-
Huss, MikaelStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)(Swepub:su)mihu5153
(författare)
-
Perez-Bercoff, Åsa
(författare)
-
Forshed, JennyKarolinska Institutet
(författare)
-
Käll, LukasKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,SeRC - Swedish e-Science Research Centre(Swepub:kth)u1gqsept
(författare)
-
Lehtiö, JanneKarolinska Institutet
(författare)
-
Karolinska InstitutetInstitutionen för biokemi och biofysik
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Methods11:1, s. 59-1548-70911548-7105
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas