The Transcriptomic and Proteomic Landscapes of Bone Marrow and Secondary Lymphoid Tissues

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-159622" > The Transcriptomic ...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Andersson, SandraUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär och morfologisk patologi (författare)

The Transcriptomic and Proteomic Landscapes of Bone Marrow and Secondary Lymphoid Tissues

Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2014-12-26
Public Library of Science (PLoS),2014
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-159622
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-159622URI
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0115911DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-243679URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

QC 20150209
Background: The sequencing of the human genome has opened doors for global gene expression profiling, and the immense amount of data will lay an important ground for future studies of normal and diseased tissues. The Human Protein Atlas project aims to systematically map the human gene and protein expression landscape in a multitude of normal healthy tissues as well as cancers, enabling the characterization of both housekeeping genes and genes that display a tissue-specific expression pattern. This article focuses on identifying and describing genes with an elevated expression in four lymphohematopoietic tissue types (bone marrow, lymph node, spleen and appendix), based on the Human Protein Atlas-strategy that combines high throughput transcriptomics with affinity-based proteomics. Results: An enriched or enhanced expression in one or more of the lymphohematopoietic tissues, compared to other tissue-types, was seen for 693 out of 20,050 genes, and the highest levels of expression were found in bone marrow for neutrophilic and erythrocytic genes. A majority of these genes were found to constitute well-characterized genes with known functions in lymphatic or hematopoietic cells, while others are not previously studied, as exemplified by C19ORF59. Conclusions: In this paper we present a strategy of combining next generation RNA-sequencing with in situ affinity-based proteomics in order to identify and describe new gene targets for further research on lymphatic or hematopoietic cells and tissues. The results constitute lists of genes with enriched or enhanced expression in the four lymphohematopoietic tissues, exemplified also on protein level with immunohistochemical images.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Annan medicin och hälsovetenskap Övrig annan medicin och hälsovetenskap hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Other Medical and Health Sciences Other Medical and Health Sciences not elsewhere specified hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Klinisk laboratoriemedicin hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Clinical Laboratory Medicine hsv//eng
appendix
Article
bone marrow
comparative study
controlled study
erythrocyte
gene expression profiling
gene function
gene identification
gene location
gene targeting
genetic analysis
genetic transcription
human
human cell
human tissue
immunohistochemistry
lymph node
lymphoid cell
neutrophil
proteomics
RNA sequence
spleen
Pathology

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Nilsson, KennethUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)kennils (författare)
Fagerberg, LinnKTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u1dglfid (författare)
Hallström, Björn M.KTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u1ih19oh (författare)
Sundström, ChristerUppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Rose-Marie Amini(Swepub:uu)chrisund (författare)
Danielsson, AngelikaUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)angda896 (författare)
Edlund, KarolinaUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)kaedl086 (författare)
Uhlén, MathiasKTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u1dulvmw (författare)
Asplund, AnnaUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär och morfologisk patologi(Swepub:uu)annaaspl (författare)
Uppsala universitetScience for Life Laboratory, SciLifeLab (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:PLOS ONE: Public Library of Science (PLoS)9:12, s. e115911-1932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

PLOS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Andersson, Sandr ...; Nilsson, Kenneth; Fagerberg, Linn; Hallström, Björn ...; Sundström, Chris ...; Danielsson, Ange ...; visa fler...; Edlund, Karolina; Uhlén, Mathias; Asplund, Anna; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Annan medicin oc ...; och Övrig annan medi ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Klinisk laborato ...

Artiklar i publikationen: PLOS ONE

Av lärosätet: Kungliga Tekniska Högskolan; Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se