SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-196159"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-196159" > Single cell analysi...

Single cell analysis of cancer cells using an improved RT-MLPA method has potential for cancer diagnosis and monitoring

Kvastad, Linda (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Werne Solnestam, Beata (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Johansson, Elin (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
visa fler...
Nygren, A. O. (författare)
Laddach, N. (författare)
Sahlén, Pelin (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Vickovic, Sanja (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Bendigtsen, S. C. (författare)
Aaserud, M. (författare)
Floer, L. (författare)
Borgen, E. (författare)
Schwind, C. (författare)
Himmelreich, R. (författare)
Latta, D. (författare)
Lundeberg, Joakim (författare)
KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2015-11-12
2015
Engelska.
Ingår i: Scientific Reports. - : Nature Publishing Group. - 2045-2322. ; 5
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Single cell analysis techniques have great potential in the cancer genomics feld. The detection and characterization of circulating tumour cells are important for identifying metastatic disease at an early stage and monitoring it. This protocol is based on transcript profiling using Reverse Transcriptase Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (RT-MLPA), which is a specific method for simultaneous detection of multiple mRNA transcripts. Because of the small amount of (circulating) tumour cells, a pre-amplification reaction is performed after reverse transcription to generate a sufficient number of target molecules for the MLPA reaction. We designed a highly sensitive method for detecting and quantifying a panel of seven genes whose expression patterns are associated with breast cancer, and optimized the method for single cell analysis. For detection we used a fluorescence-dependent semi-quantitative method involving hybridization of unique barcodes to an array. We evaluated the method using three human breast cancer cell lines and identified specific gene expression profiles for each line. Furthermore, we applied the method to single cells and confirmed the heterogeneity of a cell population. Successful gene detection from cancer cells in human blood from metastatic breast cancer patients supports the use of RT-MLPA as a diagnostic tool for cancer genomics.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy