Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-295739" >
Circle-to-circle am...
Circle-to-circle amplification coupled with microfluidic affinity chromatography enrichment for in vitro molecular diagnostics of Zika fever and analysis of anti-flaviviral drug efficacy
-
- Soares, Ruben R. G. (författare)
- Stockholms universitet,KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Nanobioteknologi,Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, Solna, Sweden.,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
-
- Pettke, Aleksandra (författare)
- Karolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Sci Life Lab, Solna, Sweden.
-
- Robles-Remacho, Agustin (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, Solna, Sweden.
-
visa fler...
-
- Zeebaree, Sahar (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, Solna, Sweden.
-
- Ciftci, Sibel (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, Solna, Sweden.
-
- Tampere, Marianna (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Russom, Aman, Prof. 1976- (författare)
- Karolinska Institutet,KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Nanobioteknologi,Karolinska Inst, AIMES Ctr Adv Integrated Med & Engn Sci, Stockholm, Sweden.;KTH Royal Inst Technol, Stockholm, Sweden.
-
- Puumalainen, Marjo-Riitta (författare)
- Karolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Sci Life Lab, Solna, Sweden.
-
- Nilsson, Mats (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, Solna, Sweden.
-
- Madaboosi, Narayanan (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, Solna, Sweden.;Indian Inst Technol Madras, Chennai, Tamil Nadu, India.
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2021
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: Sensors and actuators. B, Chemical. - : Elsevier BV. - 0925-4005 .- 1873-3077. ; 336
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Sensitive viral diagnostic methods are increasingly in demand to tackle emerging epidemics. The Zika virus (ZIKV) is particularly relevant in tropical resource limited settings (RLS) and is associated with intermittent epidemics such as the recent 2016 ZIKV outbreak in South America, wherein Zika fever was classified by WHO as a public health emergency of international concern. Thus, there is an urgent need for widespread Zika fever diagnostics and efficient drug therapies. ZIKV diagnostics are typically performed using RT-qPCR in centralized laboratories. While extremely sensitive, RT-qPCR requires rapid heating-cooling cycles, combined with continuous fluorescence measurements to allow quantification, implying high costs and limiting availability of molecular diagnostics in RLS. Here, we report isothermal amplification of ZIKV cDNA using padlock probes followed by two rounds of Rolling Circle Amplification (RCA), termed as circle-to-circle amplification (C2CA), combined with a microfluidic affinity chromatography enrichment (mu ACE) platform. This platform allowed the detection of <17 vRNA copies per reaction mixture, equivalent to similar to 3 aM, showed a positive correlation with RT-qPCR in both average (r = 0.80) and discrete (r = 0.95) signal modes, and was validated for drug efficiency tests using in vitro infected peripheral blood mononuclear cells from 3 healthy donors. This performance shows significant promise towards highly sensitive, albeit simple and cost-effective point-of-care viral diagnostics.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Kemi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Chemical Sciences (hsv//eng)
Nyckelord
- Rolling circle amplification
- Zika virus
- Circle-to-circle amplification
- Padlock probes
- Diagnostics
- Microfluidics
- Streptavidin beads
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Soares, Ruben R. ...
-
Pettke, Aleksand ...
-
Robles-Remacho, ...
-
Zeebaree, Sahar
-
Ciftci, Sibel
-
Tampere, Mariann ...
-
visa fler...
-
Russom, Aman, Pr ...
-
Puumalainen, Mar ...
-
Nilsson, Mats
-
Madaboosi, Naray ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Kemi
- Artiklar i publikationen
-
Sensors and actu ...
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Stockholms universitet
-
Karolinska Institutet