Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-313195" >
Super-resolved spat...
Super-resolved spatial transcriptomics by deep data fusion
-
- Bergenstråhle, Ludvig (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
He, B. (författare)
-
- Bergenstråhle, Joseph (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
visa fler...
-
- Abalo, Xesús M (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Mirzazadeh, Reza (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi
-
- Thrane, Kim (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Andersson, Alma (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Andersson, Alma (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Larsson, Ludvig (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
Stakenborg, N. (författare)
-
Boeckxstaens, G. (författare)
-
Khavari, P. (författare)
-
Zou, J. (författare)
-
- Lundeberg, Joakim (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi
-
- Maaskola, Jonas (författare)
- Stockholms universitet,KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Department of Biochemistry and Biophysics, Stockholm University, Stockholm, Sweden,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),KTH Royal Institute of Technology, Sweden
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2021-11-29
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Biotechnology. - : Nature Research. - 1087-0156 .- 1546-1696. ; 40:4, s. 476-479
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Current methods for spatial transcriptomics are limited by low spatial resolution. Here we introduce a method that integrates spatial gene expression data with histological image data from the same tissue section to infer higher-resolution expression maps. Using a deep generative model, our method characterizes the transcriptome of micrometer-scale anatomical features and can predict spatial gene expression from histology images alone.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Fysik -- Subatomär fysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Physical Sciences -- Subatomic Physics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
Nyckelord
- Gene expression
- 'current
- Gene Expression Data
- Generative model
- High resolution
- Histological images
- Image data
- Spatial resolution
- Tissue sections
- Transcriptomes
- Transcriptomics
- Data fusion
- transcriptome
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Bergenstråhle, L ...
-
He, B.
-
Bergenstråhle, ...
-
Abalo, Xesús M
-
Mirzazadeh, Reza
-
Thrane, Kim
-
visa fler...
-
Andersson, Alma
-
Larsson, Ludvig
-
Stakenborg, N.
-
Boeckxstaens, G.
-
Khavari, P.
-
Zou, J.
-
Lundeberg, Joaki ...
-
Maaskola, Jonas
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Fysik
-
och Subatomär fysik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
- Artiklar i publikationen
-
Nature Biotechno ...
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Stockholms universitet