Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-328119" >
Analysis of the Hum...
Analysis of the Human Protein Atlas Weakly Supervised Single-Cell Classification competition
-
- Le, Trang (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH)
-
- Winsnes, Casper F. (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH)
-
- Axelsson, Ulrika (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH)
-
visa fler...
-
- Xu, Hao (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH)
-
- Mohanakrishnan Kaimal, Jayasankar (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH)
-
- Mahdessian, Diana (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH)
-
Dai, S. (författare)
-
Makarov, I. S. (författare)
-
Ostankovich, V. (författare)
-
Xu, Y. (författare)
-
Benhamou, E. (författare)
-
Henkel, C. (författare)
-
Solovyev, R. A. (författare)
-
Banić, N. (författare)
-
Bošnjak, V. (författare)
-
Bošnjak, A. (författare)
-
Miličević, A. (författare)
-
- Ouyang, Wei (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH)
-
- Lundberg, Emma (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2022-09-29
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Methods. - : Springer Nature. - 1548-7091 .- 1548-7105. ; 19:10, s. 1221-1229
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- While spatial proteomics by fluorescence imaging has quickly become an essential discovery tool for researchers, fast and scalable methods to classify and embed single-cell protein distributions in such images are lacking. Here, we present the design and analysis of the results from the competition Human Protein Atlas – Single-Cell Classification hosted on the Kaggle platform. This represents a crowd-sourced competition to develop machine learning models trained on limited annotations to label single-cell protein patterns in fluorescent images. The particular challenges of this competition include class imbalance, weak labels and multi-label classification, prompting competitors to apply a wide range of approaches in their solutions. The winning models serve as the first subcellular omics tools that can annotate single-cell locations, extract single-cell features and capture cellular dynamics.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Cellbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Cell Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- cell protein
- protein
- Article
- cell nucleus inclusion body
- classification
- competition
- computer model
- fluorescence imaging
- machine learning
- multilabel classification
- protein function
- protein localization
- proteomics
- single cell analysis
- human
- Humans
- Proteins
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Le, Trang
-
Winsnes, Casper ...
-
Axelsson, Ulrika
-
Xu, Hao
-
Mohanakrishnan K ...
-
Mahdessian, Dian ...
-
visa fler...
-
Dai, S.
-
Makarov, I. S.
-
Ostankovich, V.
-
Xu, Y.
-
Benhamou, E.
-
Henkel, C.
-
Solovyev, R. A.
-
Banić, N.
-
Bošnjak, V.
-
Bošnjak, A.
-
Miličević, A.
-
Ouyang, Wei
-
Lundberg, Emma
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Cellbiologi
- Artiklar i publikationen
-
Nature Methods
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan