Combined Gene Expression and Genomic Profiling Define Two Intrinsic Molecular Subtypes of Urothelial Carcinoma and Gene Signatures for Molecular Grading and Outcome

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-61170" > Combined Gene Expre...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Combined Gene Expression and Genomic Profiling Define Two Intrinsic Molecular Subtypes of Urothelial Carcinoma and Gene Signatures for Molecular Grading and Outcome

Lindgren, David (författare): Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine

Frigyesi, Attila (författare): Lund University,Lunds universitet,Anestesiologi och intensivvård,Sektion II,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Anesthesiology and Intensive Care,Section II,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine

Gudjonsson, Sigurdur (författare): Lund University,Lunds universitet,Urologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Urology,Lund University Research Groups

visa fler...

Sjödahl, Gottfrid (författare): Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine

Halldén, Christer (författare): Lund University,Lunds universitet,Klinisk kemi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Chemistry, Malmö,Lund University Research Groups

Chebil, Gunilla (författare)

Veerla, Srinivas (författare): Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine

Rydén, Tobias (författare): Lund University

Månsson, Wiking (författare): Lund University,Lunds universitet,Urologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Urology,Lund University Research Groups

Liedberg, Fredrik (författare): Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Urologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Urology,Lund University Research Groups

Höglund, Mattias (författare): Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine

visa färre...

(creator_code:org_t)

2010
2010
Engelska.
Ingår i: Cancer Research. - 0008-5472 .- 1538-7445. ; 70:9, s. 3463-3472

Relaterad länk:: http://www.ncbi.nlm.... (free); visa fler...; http://dx.doi.org/10... (free); https://urn.kb.se/re...; https://doi.org/10.1...; https://lup.lub.lu.s...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

In the present investigation, we sought to refine the classification of urothelial carcinoma by combining information on gene expression, genomic, and gene mutation levels. For these purposes, we performed gene expression analysis of 144 carcinomas, and whole genome array-CGH analysis and mutation analyses of FGFR3, PIK3CA, KRAS, HRAS, NRAS, TP53, CDKN2A, and TSC1 in 103 of these cases. Hierarchical cluster analysis identified two intrinsic molecular subtypes, MS1 and MS2, which were validated and defined by the same set of genes in three independent bladder cancer data sets. The two subtypes differed with respect to gene expression and mutation profiles, as well as with the level of genomic instability. The data show that genomic instability was the most distinguishing genomic feature of MS2 tumors, and that this trait was not dependent on TP53/MDM2 alterations. By combining molecular and pathologic data, it was possible to distinguish two molecular subtypes of T(a) and T(1) tumors, respectively. In addition, we define gene signatures validated in two independent data sets that classify urothelial carcinoma into low-grade (G(1)/G(2)) and high-grade (G(3)) tumors as well as non-muscle and muscle-invasive tumors with high precisions and sensitivities, suggesting molecular grading as a relevant complement to standard pathologic grading. We also present a gene expression signature with independent prognostic effect on metastasis and disease-specific survival. We conclude that the combination of molecular and histopathologic classification systems might provide a strong improvement for bladder cancer classification and produce new insights into the development of this tumor type.

Hitta via bibliotek

Cancer Research (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Lindgren, David; Frigyesi, Attila; Gudjonsson, Sigu ...; Sjödahl, Gottfri ...; Halldén, Christe ...; Chebil, Gunilla; visa fler...; Veerla, Srinivas; Rydén, Tobias; Månsson, Wiking; Liedberg, Fredri ...; Höglund, Mattias; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

Artiklar i publikationen: Cancer Research

Av lärosätet: Kungliga Tekniska Högskolan; Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se

Combined Gene Expression and Genomic Profiling Define Two Intrinsic Molecular Subtypes of Urothelial Carcinoma and Gene Signatures for Molecular Grading and Outcome

Ämnesord

Publikations- och innehållstyp

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub