Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-152385" >
Genetic signature t...
-
Patrick, Matthew T.Univ Michigan, MI 48109 USA
(författare)
Genetic signature to provide robust risk assessment of psoriatic arthritis development in psoriasis patients
- Artikel/kapitelEngelska2018
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2018-10-09
-
NATURE PUBLISHING GROUP,2018
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-152385
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-152385URI
-
https://doi.org/10.1038/s41467-018-06672-6DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Funding Agencies|Arthritis National Research Foundation; National Psoriasis Foundation; National Institutes of Health [R01AR042742, R01AR050511, R01AR054966, R01AR063611, R01AR065183, K01AR072129]; Foundation for the National Institutes of Health; Dermatology Foundation; Dawn and Dudley Holmes Foundation; Babcock Memorial Trust; Krembil Foundation; Doris Duke Foundation [2013106]; National Institute of Health [K08AR060802, R01AR06907]; Taubman Medical Research Institute, Frances; Kenneth Eisenberg Emerging Scholar; Ann Arbor Veterans Affairs Hospital
-
Psoriatic arthritis (PsA) is a complex chronic musculoskeletal condition that occurs in similar to 30% of psoriasis patients. Currently, no systematic strategy is available that utilizes the differences in genetic architecture between PsA and cutaneous-only psoriasis (PsC) to assess PsA risk before symptoms appear. Here, we introduce a computational pipeline for predicting PsA among psoriasis patients using data from six cohorts with amp;gt;7000 genotyped PsA and PsC patients. We identify 9 new loci for psoriasis or its subtypes and achieve 0.82 area under the receiver operator curve in distinguishing PsA vs. PsC when using 200 genetic markers. Among the top 5% of our PsA prediction we achieve amp;gt;90% precision with 100% specificity and 16% recall for predicting PsA among psoriatic patients, using conditional inference forest or shrinkage discriminant analysis. Combining statistical and machine-learning techniques, we show that the underlying genetic differences between psoriasis subtypes can be used for individualized subtype risk assessment.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Stuart, Philip E.Univ Michigan, MI 48109 USA
(författare)
-
Raja, KalpanaUniv Michigan, MI 48109 USA; Morgridge Inst Res, WI 53715 USA
(författare)
-
Gudjonsson, Johann E.Univ Michigan, MI 48109 USA
(författare)
-
Tejasvi, TrilokrajUniv Michigan, MI 48109 USA; Ann Arbor Vet Affairs Hosp, MI 48105 USA
(författare)
-
Yang, JingjingUniv Michigan, MI 48109 USA; Emory Univ, GA 30322 USA
(författare)
-
Chandran, VinodUniv Toronto, Canada
(författare)
-
Das, SayantanUniv Michigan, MI 48109 USA
(författare)
-
Callis-Duffin, KristinaUniv Utah, UT 84132 USA
(författare)
-
Ellinghaus, EvaChristian Albrechts Univ Kiel, Germany
(författare)
-
Enerbäck, CharlottaLinköpings universitet,Avdelningen för cellbiologi,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Hudkliniken i Östergötland(Swepub:liu)chaen00
(författare)
-
Esko, TonuUniv Tartu, Estonia; Broad Inst and Harvard, MA 02142 USA
(författare)
-
Franke, AndreChristian Albrechts Univ Kiel, Germany
(författare)
-
Kang, Hyun M.Univ Michigan, MI 48109 USA
(författare)
-
Krueger, Gerald G.Univ Utah, UT 84132 USA
(författare)
-
Lim, Henry W.Henry Ford Hosp, MI 48202 USA
(författare)
-
Rahman, ProtonMem Univ, Canada
(författare)
-
Rosen, Cheryl F.Univ Toronto, Canada
(författare)
-
Weidinger, StephanUniv Med Ctr Schleswig Holstein, Germany
(författare)
-
Weichenthal, MichaelUniv Med Ctr Schleswig Holstein, Germany
(författare)
-
Wen, XiaoquanUniv Michigan, MI 48109 USA
(författare)
-
Voorhees, John J.Univ Michigan, MI 48109 USA
(författare)
-
Abecasis, Goncalo R.Univ Michigan, MI 48109 USA
(författare)
-
Gladman, Dafna D.Univ Toronto, Canada
(författare)
-
Nair, Rajan P.Univ Michigan, MI 48109 USA
(författare)
-
Elder, James T.Univ Michigan, MI 48109 USA; Ann Arbor Vet Affairs Hosp, MI 48105 USA
(författare)
-
Tsoi, Lam C.Univ Michigan, MI 48105 USA
(författare)
-
Univ Michigan, MI 48109 USAUniv Michigan, MI 48109 USA; Morgridge Inst Res, WI 53715 USA
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Communications: NATURE PUBLISHING GROUP92041-1723
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Patrick, Matthew ...
-
Stuart, Philip E ...
-
Raja, Kalpana
-
Gudjonsson, Joha ...
-
Tejasvi, Trilokr ...
-
Yang, Jingjing
-
visa fler...
-
Chandran, Vinod
-
Das, Sayantan
-
Callis-Duffin, K ...
-
Ellinghaus, Eva
-
Enerbäck, Charlo ...
-
Esko, Tonu
-
Franke, Andre
-
Kang, Hyun M.
-
Krueger, Gerald ...
-
Lim, Henry W.
-
Rahman, Proton
-
Rosen, Cheryl F.
-
Weidinger, Steph ...
-
Weichenthal, Mic ...
-
Wen, Xiaoquan
-
Voorhees, John J ...
-
Abecasis, Goncal ...
-
Gladman, Dafna D ...
-
Nair, Rajan P.
-
Elder, James T.
-
Tsoi, Lam C.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Urologi och njur ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Linköpings universitet