SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-152385"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-152385" > Genetic signature t...

  • Patrick, Matthew T.Univ Michigan, MI 48109 USA (författare)

Genetic signature to provide robust risk assessment of psoriatic arthritis development in psoriasis patients

  • Artikel/kapitelEngelska2018

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2018-10-09
  • NATURE PUBLISHING GROUP,2018
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-152385
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-152385URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-018-06672-6DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Funding Agencies|Arthritis National Research Foundation; National Psoriasis Foundation; National Institutes of Health [R01AR042742, R01AR050511, R01AR054966, R01AR063611, R01AR065183, K01AR072129]; Foundation for the National Institutes of Health; Dermatology Foundation; Dawn and Dudley Holmes Foundation; Babcock Memorial Trust; Krembil Foundation; Doris Duke Foundation [2013106]; National Institute of Health [K08AR060802, R01AR06907]; Taubman Medical Research Institute, Frances; Kenneth Eisenberg Emerging Scholar; Ann Arbor Veterans Affairs Hospital
  • Psoriatic arthritis (PsA) is a complex chronic musculoskeletal condition that occurs in similar to 30% of psoriasis patients. Currently, no systematic strategy is available that utilizes the differences in genetic architecture between PsA and cutaneous-only psoriasis (PsC) to assess PsA risk before symptoms appear. Here, we introduce a computational pipeline for predicting PsA among psoriasis patients using data from six cohorts with amp;gt;7000 genotyped PsA and PsC patients. We identify 9 new loci for psoriasis or its subtypes and achieve 0.82 area under the receiver operator curve in distinguishing PsA vs. PsC when using 200 genetic markers. Among the top 5% of our PsA prediction we achieve amp;gt;90% precision with 100% specificity and 16% recall for predicting PsA among psoriatic patients, using conditional inference forest or shrinkage discriminant analysis. Combining statistical and machine-learning techniques, we show that the underlying genetic differences between psoriasis subtypes can be used for individualized subtype risk assessment.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Stuart, Philip E.Univ Michigan, MI 48109 USA (författare)
  • Raja, KalpanaUniv Michigan, MI 48109 USA; Morgridge Inst Res, WI 53715 USA (författare)
  • Gudjonsson, Johann E.Univ Michigan, MI 48109 USA (författare)
  • Tejasvi, TrilokrajUniv Michigan, MI 48109 USA; Ann Arbor Vet Affairs Hosp, MI 48105 USA (författare)
  • Yang, JingjingUniv Michigan, MI 48109 USA; Emory Univ, GA 30322 USA (författare)
  • Chandran, VinodUniv Toronto, Canada (författare)
  • Das, SayantanUniv Michigan, MI 48109 USA (författare)
  • Callis-Duffin, KristinaUniv Utah, UT 84132 USA (författare)
  • Ellinghaus, EvaChristian Albrechts Univ Kiel, Germany (författare)
  • Enerbäck, CharlottaLinköpings universitet,Avdelningen för cellbiologi,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Hudkliniken i Östergötland(Swepub:liu)chaen00 (författare)
  • Esko, TonuUniv Tartu, Estonia; Broad Inst and Harvard, MA 02142 USA (författare)
  • Franke, AndreChristian Albrechts Univ Kiel, Germany (författare)
  • Kang, Hyun M.Univ Michigan, MI 48109 USA (författare)
  • Krueger, Gerald G.Univ Utah, UT 84132 USA (författare)
  • Lim, Henry W.Henry Ford Hosp, MI 48202 USA (författare)
  • Rahman, ProtonMem Univ, Canada (författare)
  • Rosen, Cheryl F.Univ Toronto, Canada (författare)
  • Weidinger, StephanUniv Med Ctr Schleswig Holstein, Germany (författare)
  • Weichenthal, MichaelUniv Med Ctr Schleswig Holstein, Germany (författare)
  • Wen, XiaoquanUniv Michigan, MI 48109 USA (författare)
  • Voorhees, John J.Univ Michigan, MI 48109 USA (författare)
  • Abecasis, Goncalo R.Univ Michigan, MI 48109 USA (författare)
  • Gladman, Dafna D.Univ Toronto, Canada (författare)
  • Nair, Rajan P.Univ Michigan, MI 48109 USA (författare)
  • Elder, James T.Univ Michigan, MI 48109 USA; Ann Arbor Vet Affairs Hosp, MI 48105 USA (författare)
  • Tsoi, Lam C.Univ Michigan, MI 48105 USA (författare)
  • Univ Michigan, MI 48109 USAUniv Michigan, MI 48109 USA; Morgridge Inst Res, WI 53715 USA (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: NATURE PUBLISHING GROUP92041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy