Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-162726" >
Estimating heritabi...
Estimating heritability and genetic correlations from large health datasets in the absence of genetic data
-
- Jia, Gengjie (författare)
- Univ Chicago, IL 60637 USA
-
- Li, Yu (författare)
- King Abdullah Univ Sci and Technol, Saudi Arabia
-
- Zhang, Hanxin (författare)
- Univ Chicago, IL 60637 USA
-
visa fler...
-
- Chattopadhyay, Ishanu (författare)
- Univ Chicago, IL 60637 USA
-
- Jensen, Anders Boeck (författare)
- Icahn Sch Med Mt Sinai, NY 10029 USA
-
- Blair, David R. (författare)
- Univ Calif San Francisco, CA 94158 USA
-
- Davis, Lea (författare)
- Vanderbilt Univ, TN 37232 USA
-
- Robinson, Peter N. (författare)
- Jackson Lab Genom Med, CT 06032 USA
-
- Dahlen, Torsten (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Inst, Sweden
-
- Brunak, Soren (författare)
- Univ Copenhagen, Denmark
-
- Benson, Mikael (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus
-
- Edgren, Gustaf (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Inst, Sweden
-
- Cox, Nancy J. (författare)
- Vanderbilt Univ, TN 37232 USA
-
- Gao, Xin (författare)
- King Abdullah Univ Sci and Technol, Saudi Arabia
-
- Rzhetsky, Andrey (författare)
- Univ Chicago, IL 60637 USA; Univ Chicago, IL 60637 USA; Univ Chicago, IL 60637 USA
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-12-03
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Communications. - : NATURE PUBLISHING GROUP. - 2041-1723. ; 10
- Relaterad länk:
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Typically, estimating genetic parameters, such as disease heritability and between-disease genetic correlations, demands large datasets containing all relevant phenotypic measures and detailed knowledge of family relationships or, alternatively, genotypic and phenotypic data for numerous unrelated individuals. Here, we suggest an alternative, efficient estimation approach through the construction of two disease metrics from large health datasets: temporal disease prevalence curves and low-dimensional disease embeddings. We present eleven thousand heritability estimates corresponding to five study types: twins, traditional family studies, health records-based family studies, single nucleotide polymorphisms, and polygenic risk scores. We also compute over six hundred thousand estimates of genetic, environmental and phenotypic correlations. Furthermore, we find that: (1) disease curve shapes cluster into five general patterns; (2) early-onset diseases tend to have lower prevalence than late-onset diseases (Spearmans rho = 0.32, p amp;lt; 10(-16)); and (3) the disease onset age and heritability are negatively correlated (rho = -0.46, p amp;lt; 10(-16)).
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Reumatologi och inflammation (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Rheumatology and Autoimmunity (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Jia, Gengjie
-
Li, Yu
-
Zhang, Hanxin
-
Chattopadhyay, I ...
-
Jensen, Anders B ...
-
Blair, David R.
-
visa fler...
-
Davis, Lea
-
Robinson, Peter ...
-
Dahlen, Torsten
-
Brunak, Soren
-
Benson, Mikael
-
Edgren, Gustaf
-
Cox, Nancy J.
-
Gao, Xin
-
Rzhetsky, Andrey
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Reumatologi och ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Linköpings universitet
-
Karolinska Institutet