Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-181450" >
Clonal spread of ca...
-
Berglund, BjörnLinköpings universitet,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten
(författare)
Clonal spread of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae among patients at admission and discharge at a Vietnamese neonatal intensive care unit
- Artikel/kapitelEngelska2021
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2021-11-20
-
BMC,2021
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-181450
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-181450URI
-
https://doi.org/10.1186/s13756-021-01033-3DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:148191559URI
-
https://res.slu.se/id/publ/114530URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Funding Agencies|Linkoping University; Training and Research Academic Collaboration (TRAC)-Sweden-Vietnam; Swedish Foundation for International Cooperation in Research and Higher Education (STINT) [SG 2015-5972]; ALF grants, Region Ostergotland [LIO-793191, LIO-899871]
-
Background The increasing prevalence of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) is a growing problem globally, particularly in low- to middle-income countries (LMICs). Previous studies have shown high rates of CRE colonisation among patients at hospitals in LMICs, with increased risk of hospital-acquired infections. Methods We isolated carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) from faecal samples collected in 2017 from patients at admission and discharge at a Vietnamese neonatal intensive care unit (NICU). 126 CRKP were whole-genome sequenced. The phylogenetic relationship between the isolates and between clinical CRKP isolates collected in 2012-2018 at the same hospital were investigated. Results NDM-type carbapenemase-(61%) and KPC-2-encoding genes (41%) were the most common carbapenem resistance genes observed among the admission and discharge isolates. Most isolates (56%) belonged to three distinct clonal clusters of ST15, carrying bla(KPC-2), bla(NDM-1) and bla(NDM-4), respectively. Each cluster also comprised clinical isolates from blood collected at the study hospital. The most dominant ST15 clone was shown to be related to isolates collected from the same hospital as far back as in 2012. Conclusions Highly resistant CRKP were found colonising admission and discharge patients at a Vietnamese NICU, emphasising the importance of continued monitoring. Whole-genome sequencing revealed a population of CRKP consisting mostly of ST15 isolates in three clonally related clusters, each related to blood isolates collected from the same hospital. Furthermore, clinical isolates collected from previous years (dating back to 2012) were shown to likely be clonally descended from ST15 isolates in the largest cluster, suggesting a successful hospital strain which can colonise inpatients.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Hoang, Ngoc Thi BichVietnam Natl Childrens Hosp, Vietnam
(författare)
-
Lundberg, LudwigSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Karolinska Institutet,Linköpings universitet,Institutionen för biomedicinska och kliniska vetenskaper,Medicinska fakulteten,Swedish Univ Agr Sci, Sweden,Institutionen för Molekylära vetenskaper,Department of Molecular Sciences,Linköping University(Swepub:liu)n/a
(författare)
-
Le, Ngai KienVietnam Natl Childrens Hosp, Vietnam
(författare)
-
Tärnberg, MariaLinköpings universitet,Avdelningen för service och infrastruktur,Medicinska fakulteten(Swepub:liu)marta92
(författare)
-
Nilsson, MaudLinköpings universitet,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten(Swepub:liu)mauni03
(författare)
-
Bornefall, ElinLinköpings universitet,Institutionen för biomedicinska och kliniska vetenskaper,Medicinska fakulteten(Swepub:liu)n/a
(författare)
-
Khu, Dung Thi KhanhVietnam Natl Childrens Hosp, Vietnam; Training & Res Acad Collaborat TRAC Sweden Vietna, Vietnam
(författare)
-
Welander, JennyLinköpings universitet,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Klinisk mikrobiologi(Swepub:liu)jenwe68
(författare)
-
Le, Hai ThanhVietnam Natl Childrens Hosp, Vietnam; Training & Res Acad Collaborat TRAC Sweden Vietna, Vietnam
(författare)
-
Olson, LinusTraining & Res Acad Collaborat TRAC Sweden Vietna, Vietnam; Karolinska Inst, Sweden; Karolinska Inst, Sweden
(författare)
-
Dien, Tran MinhVietnam Natl Childrens Hosp, Vietnam
(författare)
-
Nilsson, Lennart ELinköpings universitet,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten(Swepub:liu)lenni43
(författare)
-
Larsson, MattiasKarolinska Institutet
(författare)
-
Hanberger, HåkanLinköpings universitet,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Infektionskliniken i Östergötland,Training & Res Acad Collaborat TRAC Sweden Vietna, Vietnam(Swepub:liu)hakha84
(författare)
-
Linköpings universitetAvdelningen för inflammation och infektion
(creator_code:org_t)
-
Sveriges lantbruksuniversitet
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Antimicrobial Resistance and Infection Control: BMC10:12047-2994
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Berglund, Björn
-
Hoang, Ngoc Thi ...
-
Lundberg, Ludwig
-
Le, Ngai Kien
-
Tärnberg, Maria
-
Nilsson, Maud
-
visa fler...
-
Bornefall, Elin
-
Khu, Dung Thi Kh ...
-
Welander, Jenny
-
Le, Hai Thanh
-
Olson, Linus
-
Dien, Tran Minh
-
Nilsson, Lennart ...
-
Larsson, Mattias
-
Hanberger, Håkan
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Hälsovetenskap
-
och Omvårdnad
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Infektionsmedici ...
- Artiklar i publikationen
-
Antimicrobial Re ...
- Av lärosätet
-
Linköpings universitet
-
Karolinska Institutet
-
Sveriges Lantbruksuniversitet