Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-197405" >
Super-resolution pr...
Super-resolution proximity labeling reveals anti-viral protein network and its structural changes against SARS-CoV-2 viral proteins
-
- Lee, Yun-Bin (författare)
- Seoul Natl Univ, South Korea
-
- Jung, Minkyo (författare)
- Korea Brain Res Inst, South Korea
-
- Kim, Jeesoo (författare)
- Seoul Natl Univ, South Korea; Inst for Basic Sci Korea, South Korea
-
visa fler...
-
- Charles, Afandi (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Christ, Wanda (författare)
- Karolinska Inst, Sweden
-
- Kang, Jiwoong (författare)
- Seoul Natl Univ, South Korea
-
- Kang, Myeong-Gyun (författare)
- Seoul Natl Univ, South Korea
-
- Kwak, Chulhwan (författare)
- Seoul Natl Univ, South Korea
-
- Klingström, Jonas (författare)
- Karolinska Institutet,Linköpings universitet,Avdelningen för molekylär medicin och virologi,Medicinska fakulteten,Karolinska Inst, Sweden
-
- Smed-Sorensen, Anna (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Kim, Jong-Seo (författare)
- Seoul Natl Univ, South Korea; Inst for Basic Sci Korea, South Korea
-
- Mun, Ji Young (författare)
- Korea Brain Res Inst, South Korea
-
- Rhee, Hyun-Woo (författare)
- Seoul Natl Univ, South Korea
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- CELL PRESS, 2023
- 2023
- Engelska.
-
Ingår i: Cell Reports. - : CELL PRESS. - 2211-1247. ; 42:8
- Relaterad länk:
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) replicates in human cells by interacting with host factors following infection. To understand the virus and host interactome proximity, we introduce a super-resolution proximity labeling (SR-PL) method with a "plug-and-playable"PL enzyme, TurboID-GBP (GFP-binding nanobody protein), and we apply it for interactome mapping of SARS-CoV-2 ORF3a and mem-brane protein (M), which generates highly perturbed endoplasmic reticulum (ER) structures. Through SR-PL analysis of the biotinylated interactome, 224 and 272 peptides are robustly identified as ORF3a and M inter-actomes, respectively. Within the ORF3a interactome, RNF5 co-localizes with ORF3a and generates ubiquitin modifications of ORF3a that can be involved in protein degradation. We also observe that the SARS-CoV-2 infection rate is efficiently reduced by the overexpression of RNF5 in host cells. The interactome data ob-tained using the SR-PL method are presented at https://sarscov2.spatiomics.org. We hope that our method will contribute to revealing virus-host interactions of other viruses in an efficient manner.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinsk bioteknologi -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Medical Biotechnology -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Lee, Yun-Bin
-
Jung, Minkyo
-
Kim, Jeesoo
-
Charles, Afandi
-
Christ, Wanda
-
Kang, Jiwoong
-
visa fler...
-
Kang, Myeong-Gyu ...
-
Kwak, Chulhwan
-
Klingström, Jona ...
-
Smed-Sorensen, A ...
-
Kim, Jong-Seo
-
Mun, Ji Young
-
Rhee, Hyun-Woo
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
och Medicinsk biotek ...
- Artiklar i publikationen
-
Cell Reports
- Av lärosätet
-
Linköpings universitet
-
Karolinska Institutet