Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-96427" >
Unbiased Approach f...
Unbiased Approach for Virus Detection in Skin Lesions
-
- Bzhalava, Davit (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
-
- Johansson, Hanna K (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Lund University, Malmö, Sweden
-
- Ekström, Johanna (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
-
visa fler...
-
- Faust, Helena (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Lund University, Malmö, Sweden
-
- Moller, Birgitta (författare)
- Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
-
- Eklund, Carina (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
-
- Nordin, Peter (författare)
- Läkarhuset, Gothenburg, Sweden
-
- Stenquist, Bo (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för dermatologi och venereologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Dermatology and Venereology,University of Gothenburg, Sweden
-
- Paoli, John, 1975 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för dermatologi och venereologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Dermatology and Venereology,University of Gothenburg, Sweden
-
- Persson, Bengt (författare)
- Linköpings universitet,Bioinformatik,Tekniska högskolan
-
- Forslund, Ola (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Lund University, Malmö, Sweden
-
- Dillner, Joakim (författare)
- Karolinska Institutet,Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2013-06-28
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: PLOS ONE. - : Public Library of Science. - 1932-6203. ; 8:6
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://journals.plo...
-
https://portal.resea... (primary) (free)
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- To assess presence of virus DNA in skin lesions, swab samples from 82 squamous cell carcinomas of the skin (SCCs), 60 actinic keratoses (AKs), paraffin-embedded biopsies from 28 SCCs and 72 kerathoacanthomas (KAs) and fresh-frozen biopsies from 92 KAs, 85 SCCs and 92 AKs were analyzed by high throughput sequencing (HTS) using 454 or Ion Torrent technology. We found total of 4,284 viral reads, out of which 4,168 were Human Papillomavirus (HPV)-related, belonging to 15 known (HPV8, HPV12, HPV20, HPV36, HPV38, HPV45, HPV57, HPV59, HPV104, HPV105, HPV107, HPV109, HPV124, HPV138, HPV147), four previously described putative (HPV 915 F 06 007 FD1, FA73, FA101, SE42) and two putatively new HPV types (SE46, SE47). SE42 was cloned, sequenced, designated as HPV155 and found to have 76% similarity to the most closely related known HPV type. In conclusion, an unbiased approach for viral DNA detection in skin tumors has found that, although some new putative HPVs were found, known HPV types constituted most of the viral DNA.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Dermatologi och venereologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Dermatology and Venereal Diseases (hsv//eng)
Nyckelord
- TECHNOLOGY
- TEKNIKVETENSKAP
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
PLOS ONE
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Bzhalava, Davit
-
Johansson, Hanna ...
-
Ekström, Johanna
-
Faust, Helena
-
Moller, Birgitta
-
Eklund, Carina
-
visa fler...
-
Nordin, Peter
-
Stenquist, Bo
-
Paoli, John, 197 ...
-
Persson, Bengt
-
Forslund, Ola
-
Dillner, Joakim
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Dermatologi och ...
- Artiklar i publikationen
-
PLOS ONE
- Av lärosätet
-
Linköpings universitet
-
Lunds universitet
-
Göteborgs universitet
-
Karolinska Institutet