SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-533305"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-533305" > Ghost admixture in ...

  • Pawar, HarvinderInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain. (författare)

Ghost admixture in eastern gorillas

  • Artikel/kapitelEngelska2023

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Springer Nature,2023
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-533305
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-533305URI
  • https://doi.org/10.1038/s41559-023-02145-2DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:nrm:diva-5335URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Archaic admixture has had a significant impact on human evolution with multiple events across different clades, including from extinct hominins such as Neanderthals and Denisovans into modern humans. Within the great apes archaic admixture has been identified in chimpanzees and bonobos, but the possibility of such events has not been explored in other species. Here, we address this question using high-coverage whole genome sequences from all four extant gorilla subspecies, including six newly sequenced eastern gorillas from previously unsampled geographic regions. Using Approximate Bayesian Computation (ABC) with neural networks to model the demographic history of gorillas, we find a signature of admixture from an archaic 'ghost' lineage into the common ancestor of eastern gorillas, but not western gorillas. We infer that up to 3% of the genome of these individuals is introgressed from an archaic lineage that diverged more than 3 million years ago from the common ancestor of all extant gorillas. This introgression event took place before the split of mountain and eastern lowland gorillas, likely more than 40 thousand years ago, and may have influenced perception of bitter taste in eastern gorillas. When comparing the introgression landscapes of gorillas, humans and bonobos, we find a consistent depletion of introgressed fragments on the X chromosome across these species. However, depletion in protein-coding content is not detectable in eastern gorillas, possibly as a consequence of stronger genetic drift in this species.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Rymbekova, AigerimUniv Vienna, Dept Evolutionary Anthropol, Vienna, Austria.;Univ Vienna, Human Evolut & Archaeol Sci HEAS, Vienna, Austria. (författare)
  • Cuadros-Espinoza, SebastianInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain. (författare)
  • Huang, XinUniv Vienna, Dept Evolutionary Anthropol, Vienna, Austria.;Univ Vienna, Human Evolut & Archaeol Sci HEAS, Vienna, Austria. (författare)
  • de Manuel, MarcInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain. (författare)
  • van der Valk, TomNaturhistoriska riksmuseet,Enheten för bioinformatik och genetik,Swedish Museum Nat Hist, Dept Bioinformat & Genet, Scilifelab, Stockholm, Sweden.;Ctr Palaeogenet, Stockholm, Sweden.(Swepub:nrm)tomvande (författare)
  • Lobon, IreneInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain. (författare)
  • Alvarez-Estape, MarinaInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain. (författare)
  • Haber, MarcUniv Birmingham, Inst Canc & Genom Sci, Dubai, U Arab Emirates. (författare)
  • Dolgova, OlgaCIC bioGUNE Ctr Invest Cooperat Biociencias, Integrat Genom Lab, Parque Cient Tecnol Bizkaia Bldg 801A, Derio, Spain. (författare)
  • Han, SojungInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain.;Univ Vienna, Dept Evolutionary Anthropol, Vienna, Austria.;Univ Vienna, Human Evolut & Archaeol Sci HEAS, Vienna, Austria. (författare)
  • Esteller-Cucala, PaulaInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain. (författare)
  • Juan, DavidInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain. (författare)
  • Ayub, QasimWellcome Sanger Inst, Hinxton, England.;Monash Univ Malaysia, Genom Facil, Sch Sci, Batang Berjuntai, Selangor Darul, Malaysia. (författare)
  • Bautista, RubenWellcome Sanger Inst, Hinxton, England. (författare)
  • Kelley, Joanna L.Univ Calif Santa Cruz, Dept Ecol & Evolutionary Biol, Santa Cruz, CA USA. (författare)
  • Cornejo, Omar. E.Univ Calif Santa Cruz, Dept Ecol & Evolutionary Biol, Santa Cruz, CA USA. (författare)
  • Lao, OscarInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain. (författare)
  • Andres, Aida. M.UCL, UCL Genet Inst, Dept Genet Evolut & Environm, London, England. (författare)
  • Guschanski, Katerina,Dr.1978-Uppsala universitet,Zooekologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Univ Edinburgh, Inst Ecol & Evolut, Sch Biol Sci, Edinburgh, Scotland(Swepub:uu)katgu490 (författare)
  • Ssebide, BenardGorilla Doctors, Kampala, Uganda. (författare)
  • Cranfield, MikeUniv Calif Davis, One Hlth Inst, Karen C Drayer Wildlife Hlth Ctr, Sch Vet Med, Davis, CA USA. (författare)
  • Tyler-Smith, ChrisWellcome Sanger Inst, Hinxton, England. (författare)
  • Xue, YaliWellcome Sanger Inst, Hinxton, England. (författare)
  • Prado-Martinez, JavierInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain.;Wellcome Sanger Inst, Hinxton, England. (författare)
  • Marques-Bonet, TomasInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain.;Catalan Inst Res & Adv Studies ICREA, Passeig Lluis Co, Barcelona, Spain.;Barcelona Inst Sci & Technol BIST, Ctr Genom Regulat CRG, CNAG CRG, Barcelona, Spain.;Univ Autonoma Barcelona, Inst Catala Paleontol Miquel Crusafont, Edif ICTA ICP, Barcelona, Spain. (författare)
  • Kuhlwilm, MartinInst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain.;Univ Vienna, Dept Evolutionary Anthropol, Vienna, Austria.;Univ Vienna, Human Evolut & Archaeol Sci HEAS, Vienna, Austria. (författare)
  • Inst Evolutionary Biol UPF CSIC, PRBB, Barcelona, Spain.Univ Vienna, Dept Evolutionary Anthropol, Vienna, Austria.;Univ Vienna, Human Evolut & Archaeol Sci HEAS, Vienna, Austria. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Ecology & Evolution: Springer Nature7:9, s. 1503-15142397-334X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy