Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:sh-14447" >
Genomewide analysis...
Genomewide analysis of nucleosome density histone acetylation and HDAC function in fission yeast
-
- Wiren, Marianna (författare)
- Södertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet
-
- Silverstein, Rebecca A (författare)
- Södertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet
-
- Sinha, Indranil (författare)
- Södertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet
-
visa fler...
-
- Walfridsson, Julian (författare)
- Södertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet
-
- Lee, Hang-mao (författare)
- Södertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet
-
- Laurenson, P (författare)
- University of California, San Diego, USA
-
- Pillus, L (författare)
- University of California, San Diego, USA
-
- Robyr, D (författare)
- University of California, Los Angeles, USA
-
- Grunstein, M (författare)
- University of California, Los Angeles, USA
-
- Ekwall, Karl (författare)
- Södertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2005-08-04
- 2005
- Engelska.
-
Ingår i: EMBO Journal. - : Wiley. - 0261-4189 .- 1460-2075. ; 24:16, s. 2906-2918
- Relaterad länk:
-
http://www.ncbi.nlm....
-
visa fler...
-
https://europepmc.or...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- We have conducted a genomewide investigation into the enzymatic specificity, expression profiles, and binding locations of four histone deacetylases (HDACs), representing the three different phylogenetic classes in fission yeast ( Schizosaccharomyces pombe). By directly comparing nucleosome density, histone acetylation patterns and HDAC binding in both intergenic and coding regions with gene expression profiles, we found that Sir2 ( class III) and Hos2 ( class I) have a role in preventing histone loss; Clr6 ( class I) is the principal enzyme in promoter-localized repression. Hos2 has an unexpected role in promoting high expression of growth-related genes by deacetylating H4K16Ac in their open reading frames. Clr3 ( class II) acts cooperatively with Sir2 throughout the genome, including the silent regions: rDNA, centromeres, mat2/3 and telomeres. The most significant acetylation sites are H3K14Ac for Clr3 and H3K9Ac for Sir2 at their genomic targets. Clr3 also affects subtelomeric regions which contain clustered stress- and meiosis-induced genes. Thus, this combined genomic approach has uncovered different roles for fission yeast HDACs at the silent regions in repression and activation of gene expression.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Wiren, Marianna
-
Silverstein, Reb ...
-
Sinha, Indranil
-
Walfridsson, Jul ...
-
Lee, Hang-mao
-
Laurenson, P
-
visa fler...
-
Pillus, L
-
Robyr, D
-
Grunstein, M
-
Ekwall, Karl
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
EMBO Journal
- Av lärosätet
-
Södertörns högskola
-
Karolinska Institutet