SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-147177"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-147177" > AspWood :

AspWood : High-Spatial-Resolution Transcriptome Profiles Reveal Uncharacterized Modularity of Wood Formation in Populus tremula

Sundell, David (författare)
Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik
Street, Nathaniel R. (författare)
Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik
Kumar, Manoj (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
visa fler...
Mellerowicz, Ewa (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Kucukoglu, Melis (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Johnsson, Christoffer (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Kumar, Vikash (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Mannapperuma, Chanaka (författare)
Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik
Delhomme, Nicolas (författare)
Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå University
Nilsson, Ove (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Tuominen, Hannele (författare)
Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik
Pesquet, Edouard (författare)
Umeå universitet,Stockholms universitet,Institutionen för ekologi, miljö och botanik,Umeå University, Sweden,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik,Department of Ecology, Environment and Plant Sciences, Stockholm University, 106 91 Stockholm, Sweden
Fischer, Urs (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Niittylä, Totte (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Sundberg, Björn (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Hvidsten, Torgeir R. (författare)
Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik,Department of Chemistry, Biotechnology and Food Sciences, Norwegian University of Life Sciences, 1433 Ås, Norway
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
2017-06-27
2017
Engelska.
Ingår i: The Plant Cell. - : Oxford University Press (OUP). - 1040-4651 .- 1532-298X. ; 29:7, s. 1585-1604
Relaterad länk:
http://www.plantcell...
visa fler...
https://doi.org/10.1...
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
https://urn.kb.se/re...
https://res.slu.se/i...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Trees represent the largest terrestrial carbon sink and a renewable source of ligno-cellulose. There is significant scope for yield and quality improvement in these largely undomesticated species, and efforts to engineer elite varieties will benefit from improved understanding of the transcriptional network underlying cambial growth and wood formation. We generated high-spatial-resolution RNA sequencing data spanning the secondary phloem, vascular cambium, and wood-forming tissues of Populus tremula. The transcriptome comprised 28,294 expressed, annotated genes, 78 novel protein-coding genes, and 567 putative long intergenic noncoding RNAs. Most paralogs originating from the Salicaceae whole-genome duplication had diverged expression, with the exception of those highly expressed during secondary cell wall deposition. Coexpression network analyses revealed that regulation of the transcriptome underlying cambial growth and wood formation comprises numerous modules forming a continuum of active processes across the tissues. A comparative analysis revealed that a majority of these modules are conserved in Picea abies. The high spatial resolution of our data enabled identification of novel roles for characterized genes involved in xylan and cellulose biosynthesis, regulators of xylem vessel and fiber differentiation and lignification. An associated web resource (AspWood, http://aspwood.popgenie.org) provides interactive tools for exploring the expression profiles and coexpression network.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
LANTBRUKSVETENSKAPER  -- Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske -- Trävetenskap (hsv//swe)
AGRICULTURAL SCIENCES  -- Agriculture, Forestry and Fisheries -- Wood Science (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Botanik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Botany (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Utvecklingsbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Developmental Biology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy