Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-188733" >
A ribonucleotide re...
A ribonucleotide reductase from Clostridium botulinum reveals distinct evolutionary pathways to regulation via the overall activity site
-
- Martínez-Carranza, Markel (författare)
- Stockholm University,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
- Jonna, Venkateswara Rao (författare)
- Umeå University,Umeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik
-
- Lundin, Daniel (författare)
- Stockholm University,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
visa fler...
-
- Sahlin, Margareta (författare)
- Stockholm University,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
- Carlson, Lars-Anders (författare)
- Umeå University,Umeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik,Wallenberg centrum för molekylär medicin vid Umeå universitet (WCMM)
-
- Jemal, Newal (författare)
- Umeå University,Umeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik
-
- Högbom, Martin (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
- Sjöberg, Britt-Marie (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
- Stenmark, Pål (författare)
- Stockholm University,Lunds universitet,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Lund University, Sweden,Strukturell biokemi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Structural Biochemistry,Lund University Research Groups
-
- Hofer, Anders (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2020
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Biological Chemistry. - : American Society for Biochemistry and Molecular Biology. - 0021-9258 .- 1083-351X. ; 295:46, s. 15576-15587
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Ribonucleotide reductase (RNR) is a central enzyme for the synthesis of DNA building blocks. Most aerobic organisms, including nearly all eukaryotes, have class I RNRs consisting of R1 and R2 subunits. The catalytic R1 subunit contains an overall activity site that can allosterically turn the enzyme on or off by the binding of ATP or dATP, respectively. The mechanism behind the ability to turn the enzyme off via the R1 subunit involves the formation of different types of R1 oligomers in most studied species and R1–R2 octamers in Escherichia coli. To better understand the distribution of different oligomerization mechanisms, we characterized the enzyme from Clostridium botulinum, which belongs to a subclass of class I RNRs not studied before. The recombinantly expressed enzyme was analyzed by size-exclusion chromatography, gas-phase electrophoretic mobility macromolecular analysis, EM, X-ray crystallography, and enzyme assays. Interestingly, it shares the ability of the E. coli RNR to form inhibited R1–R2 octamers in the presence of dATP but, unlike the E. coli enzyme, cannot be turned off by combinations of ATP and dGTP/dTTP. A phylogenetic analysis of class I RNRs suggests that activity regulation is not ancestral but was gained after the first subclasses diverged and that RNR subclasses with inhibition mechanisms involving R1 oligomerization belong to a clade separated from the two subclasses forming R1–R2 octamers. These results give further insight into activity regulation in class I RNRs as an evolutionarily dynamic process.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Läkemedelskemi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medicinal Chemistry (hsv//eng)
Nyckelord
- Clostridium botulinum
- ribonucleotide reductase
- allosteric regulation
- overall activity regulation
- inhibition mechanism
- a-site
- oligomerization
- phylogenetics
- evolution
- structure–
- function
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas