Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-194363" >
In Silico Mining of...
-
Ibrahim, Mahmoud A. A.
(författare)
In Silico Mining of Terpenes from Red-Sea Invertebrates for SARS-CoV-2 Main Protease (M-pro) Inhibitors
- Artikel/kapitelEngelska2021
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2021-04-05
-
MDPI AG,2021
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-194363
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-194363URI
-
https://doi.org/10.3390/molecules26072082DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the causative agent for the COVID-19 pandemic, which generated more than 1.82 million deaths in 2020 alone, in addition to 83.8 million infections. Currently, there is no antiviral medication to treat COVID-19. In the search for drug leads, marine-derived metabolites are reported here as prospective SARS-CoV-2 inhibitors. Two hundred and twenty-seven terpene natural products isolated from the biodiverse Red-Sea ecosystem were screened for inhibitor activity against the SARS-CoV-2 main protease (M-pro) using molecular docking and molecular dynamics (MD) simulations combined with molecular mechanics/generalized Born surface area binding energy calculations. On the basis of in silico analyses, six terpenes demonstrated high potency as M-pro inhibitors with Delta G(binding) <= -40.0 kcal/mol. The stability and binding affinity of the most potent metabolite, erylosides B, were compared to the human immunodeficiency virus protease inhibitor, lopinavir. Erylosides B showed greater binding affinity towards SARS-CoV-2 M-pro than lopinavir over 100 ns with Delta G(binding) values of -51.9 vs. -33.6 kcal/mol, respectively. Protein-protein interactions indicate that erylosides B biochemical signaling shares gene components that mediate severe acute respiratory syndrome diseases, including the cytokine- and immune-signaling components BCL2L1, IL2, and PRKC. Pathway enrichment analysis and Boolean network modeling were performed towards a deep dissection and mining of the erylosides B target-function interactions. The current study identifies erylosides B as a promising anti-COVID-19 drug lead that warrants further in vitro and in vivo testing.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Abdelrahman, Alaa H. M.
(författare)
-
Mohamed, Tarik A.
(författare)
-
Atia, Mohamed A. M.
(författare)
-
Al-Hammady, Montaser A. M.
(författare)
-
Abdeljawaad, Khlood A. A.
(författare)
-
Elkady, Eman M.
(författare)
-
Moustafa, Mahmoud F.
(författare)
-
Alrumaihi, Faris
(författare)
-
Allemailem, Khaled S.
(författare)
-
El-Seedi, Hesham R.Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,El-Menoufia University, Egypt; Jiangsu University, China(Swepub:su)heel9493
(författare)
-
Paré, Paul W.
(författare)
-
Efferth, Thomas
(författare)
-
Hegazy, Mohamed-Elamir F.
(författare)
-
Stockholms universitetInstitutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Molecules: MDPI AG26:71431-51571420-3049
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ibrahim, Mahmoud ...
-
Abdelrahman, Ala ...
-
Mohamed, Tarik A ...
-
Atia, Mohamed A. ...
-
Al-Hammady, Mont ...
-
Abdeljawaad, Khl ...
-
visa fler...
-
Elkady, Eman M.
-
Moustafa, Mahmou ...
-
Alrumaihi, Faris
-
Allemailem, Khal ...
-
El-Seedi, Hesham ...
-
Paré, Paul W.
-
Efferth, Thomas
-
Hegazy, Mohamed- ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
och Medicinsk biotek ...
- Artiklar i publikationen
-
Molecules
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet