Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-200009" >
MapToCleave :
MapToCleave : High-throughput profiling of microRNA biogenesis in living cells
-
- Kang, Wenjing, 1988- (författare)
- Stockholms universitet,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,Stockholm Univ, Wenner Gren Inst, Dept Mol Biosci, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.;UiT Arctic Univ Norway, Arctic Univ Museum Norway, Tromso, Norway.
-
- Fromm, Bastian (författare)
- Stockholms universitet,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,UiT - The Arctic University of Norway, Norway,Stockholm Univ, Wenner Gren Inst, Dept Mol Biosci, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.
-
- Houben, Anna J. (författare)
- Barcelona Inst Sci & Technol, Ctr Genom Regulat CRG, Barcelona, Spain.
-
visa fler...
-
- Høye, Eirik (författare)
- Oslo Univ Hosp, Oslo Inst Canc Res, Dept Tumor Biol, Oslo, Norway.
-
- Bezdan, Daniela (författare)
- Barcelona Inst Sci & Technol, Ctr Genom Regulat CRG, Barcelona, Spain.;Univ Tubingen, Inst Med Genet & Appl Genom, Tubingen, Germany.;Univ Tubingen, NGS Competence Ctr T ubingen NCCT, Tubingen, Germany.
-
- Arnan, Carme (författare)
- Barcelona Inst Sci & Technol, Ctr Genom Regulat CRG, Barcelona, Spain.
-
- Thrane, Kim (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Asp, Michaela (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Johnson, Rory (författare)
- Univ Bern, Univ Hosp Bern, Dept Med Oncol, Inselspital, Bern, Switzerland.;Univ Bern, Dept BioMed Res, Bern, Switzerland.;Univ Coll Dublin, Sch Biol & Environm Sci, Dublin, Ireland.;Univ Coll Dublin, Conway Inst Biomol & Biomed Res, Dublin, Ireland.
-
- Biryukova, Inna (författare)
- Stockholms universitet,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,Stockholm Univ, Wenner Gren Inst, Dept Mol Biosci, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.
-
- Friedländer, Marc R. (författare)
- Stockholms universitet,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,Stockholm Univ, Wenner Gren Inst, Dept Mol Biosci, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2021
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: Cell Reports. - : Elsevier BV. - 2211-1247. ; 37:7
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
http://www.cell.com/...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Previous large-scale studies have uncovered many features that determine the processing of microRNA (miRNA) precursors; however, they have been conducted in vitro. Here, we introduce MapToCleave, a method to simultaneously profile processing of thousands of distinct RNA structures in living cells. We find that miRNA precursors with a stable lower basal stem are more efficiently processed and also have higher expression in vivo in tissues from 20 animal species. We systematically compare the importance of known and novel sequence and structural features and test biogenesis of miRNA precursors from 10 animal and plant species in human cells. Lastly, we provide evidence that the GHG motif better predicts processing when defined as a structure rather than sequence motif, consistent with recent cryogenic electron microscopy (cryo-EM) studies. In summary, we apply a screening assay in living cells to reveal the importance of lower basal stem stability for miRNA processing and in vivo expression.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- miRNA
- microRNA
- biogenesis
- large-scale
- comparative biology
- RNA structure
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Kang, Wenjing, 1 ...
-
Fromm, Bastian
-
Houben, Anna J.
-
Høye, Eirik
-
Bezdan, Daniela
-
Arnan, Carme
-
visa fler...
-
Thrane, Kim
-
Asp, Michaela
-
Johnson, Rory
-
Biryukova, Inna
-
Friedländer, Mar ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Cell Reports
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet
-
Kungliga Tekniska Högskolan