SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-209347"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-209347" > Multi-omics persona...

  • Ambikan, Anoop T.Karolinska Institutet (författare)

Multi-omics personalized network analyses highlight progressive disruption of central metabolism associated with COVID-19 severity

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Elsevier BV,2022
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-209347
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-209347URI
  • https://doi.org/10.1016/j.cels.2022.06.006DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-317356URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:150590692URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • QC 20220909
  • The clinical outcome and disease severity in coronavirus disease 2019 (COVID-19) are heterogeneous, and the progression or fatality of the disease cannot be explained by a single factor like age or comorbidities. In this study, we used system-wide network-based system biology analysis using whole blood RNA sequencing, immunophenotyping by flow cytometry, plasma metabolomics, and single-cell-type metabolo-mics of monocytes to identify the potential determinants of COVID-19 severity at personalized and group levels. Digital cell quantification and immunophenotyping of the mononuclear phagocytes indicated a sub-stantial role in coordinating the immune cells that mediate COVID-19 severity. Stratum-specific and person-alized genome-scale metabolic modeling indicated monocarboxylate transporter family genes (e.g., SLC16A6), nucleoside transporter genes (e.g., SLC29A1), and metabolites such as a-ketoglutarate, succi-nate, malate, and butyrate could play a crucial role in COVID-19 severity. Metabolic perturbations targeting the central metabolic pathway (TCA cycle) can be an alternate treatment strategy in severe COVID-19.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Yang, HongKTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u150v7zg (författare)
  • Krishnan, ShubaKarolinska Inst, Dept Lab Med, Div Clin Microbiol, Syst Virol Lab, Stockholm S-14152, Sweden. (författare)
  • Svensson Akusjarvi, SaraKarolinska Institutet (författare)
  • Gupta, SohamKarolinska Institutet (författare)
  • Lourda, MagdaKarolinska Institutet (författare)
  • Sperk, MaikeKarolinska Inst, Dept Lab Med, Div Clin Microbiol, Syst Virol Lab, Stockholm S-14152, Sweden. (författare)
  • Arif, MuhammadKTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u1vvaean (författare)
  • Zhang, ChengKTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u1ww5kvp (författare)
  • Nordqvist, HampusSouth Gen Hosp, Sodersjukhuset, S-11883 Stockholm, Sweden. (författare)
  • Ponnan, Sivasankaran MunusamyFred Hutchinson Canc Res Ctr FHCRC, HIV Vaccine Trials Network, Vaccine & Infect Dis, Seattle, WA 98109 USA. (författare)
  • Sonnerborg, AndersKarolinska Institutet (författare)
  • Treutiger, Carl JohanKarolinska Univ Hosp, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge, Div Infect Dis, I73, S-14186 Huddinge, Stockholm, Sweden. (författare)
  • O'Mahony, LiamNatl Univ Ireland, Univ Coll Cork, Sch Microbiol, Cork T12YN60, Ireland.;Natl Univ Ireland, Univ Coll Cork, APC Microbiome Ireland, Cork T12YN60, Ireland.;Natl Univ Ireland, Univ Coll Cork, Dept Med, Cork T12YN60, Ireland. (författare)
  • Mardinoglu, AdilKTH,Systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Kings Coll London, Fac Dent Oral & Craniofacial Sci, Ctr Host Microbiome Interact, London WC2RLS, England.(Swepub:kth)u1t8kmr6 (författare)
  • Benfeitas, RuiStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, Natl Bioinformat Infrastructure Sweden NBIS, S-10691 Stockholm, Sweden.(Swepub:su)rube5211 (författare)
  • Neogi, UjjwalKarolinska Institutet (författare)
  • Karolinska InstitutetSystembiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Cell systems: Elsevier BV13:8, s. 665-6812405-47122405-4720

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy