SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-220785"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-220785" > The exosome degrade...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00003420nam a2200313 4500
001oai:DiVA.org:su-220785
003SwePub
008230911| | |||||||||||000 ||eng|
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-2207852 URI
040 a (SwePub)su
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a vet2 swepub-contenttype
072 7a ovr2 swepub-publicationtype
1001 a Planells, Jordiu Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,Visa4 aut
2451 0a The exosome degrades chromatin-associated RNAs genome-wide and maintains chromatin homeostasis
338 a print2 rdacarrier
520 a Chromatin-associated RNAs (caRNAs) modulate chromatin organization and function. The RNAexosome degrades different types of nuclear transcripts, but its role in chromatin has not beenaddressed. Here we have used Drosophila melanogaster S2 cells as a model system to identify therepertoire of caRNAs and establish the role of the exosome in their regulation. We have analyzed bothunique and repetitive sequences, and combining RNA-seq and ATAC-seq we show that thesimultaneous depletion of the exosome catalytic subunits RRP6 and DIS3 not only affects caRNAlevels but also changes the local chromatin accessibility at specific loci. We have identified a group ofexosome-sensitive genes that are involved in developmental regulation and are characterized by abalanced chromatin state in which Polycomb and Trithorax factors coexist. Our results reveal that RNAdegradation by the exosome is an important mechanism for the homeostasis of such balancedchromatin states. Given that eukaryotic genomes are repetitive to a large extent, we have also analyzed repetitive caRNAs (rep-caRNAs) and we show that the exosome is needed to control repcaRNAlevels and to maintain the degree of chromatin packaging in repetitive genomic regions. Thisrole is particularly relevant in the pericentromeric regions where the exosome is required to silenceLTR elements and maintain centromere organization.
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Biokemi och molekylärbiologi0 (SwePub)106022 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Biochemistry and Molecular Biology0 (SwePub)106022 hsv//eng
7001 a Jordán-Pla, Antoniou Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut4 aut0 (Swepub:su)ajord
7001 a Jain, Shrutiu Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut4 aut0 (Swepub:su)shja0305
7001 a Guadalupe, Juan Joseu Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut4 aut
7001 a Proux-Wéra, Estelleu Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)4 aut0 (Swepub:su)eprou
7001 a von Euler, Anneu Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut4 aut0 (Swepub:su)avone
7001 a Pelechano, Vicentu Stockholms universitet,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)4 aut
7001 a Visa, Neusu Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut4 aut0 (Swepub:su)neus
7102 a Stockholms universitetb Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut4 org
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-220785

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy