Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-224234" >
Genome-scale phylog...
Genome-scale phylogeny and comparative genomics of the fungal order Sordariales
-
- Hensen, Noah (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för ekologi, miljö och botanik
-
Bonometti, Lucas (författare)
-
Westerberg, Ivar (författare)
-
visa fler...
-
- Onuţ-Brännström, Ioana (författare)
- Uppsala universitet,Evolutionsbiologi,Univ Oslo, Nat Hist Museum, Oslo, Norway.
-
Guillou, Sonia (författare)
-
Cros-Aarteil, Sandrine (författare)
-
Calhoun, Sara (författare)
-
Haridas, Sajeet (författare)
-
Kuo, Alan (författare)
-
Mondo, Stephen (författare)
-
Pangilinan, Jasmyn (författare)
-
Riley, Robert (författare)
-
Labutti, Kurt (författare)
-
Andreopoulos, Bill (författare)
-
Lipzen, Anna (författare)
-
Chen, Cindy (författare)
-
Yan, Mi (författare)
-
Daum, Chris (författare)
-
Ng, Vivian (författare)
-
Clum, Alicia (författare)
-
Steindorff, Andrei (författare)
-
Ohm, Robin A. (författare)
-
Martin, Francis (författare)
-
Silar, Philippe (författare)
-
Natvig, Donald O. (författare)
-
Lalanne, Christophe (författare)
-
Gautier, Valerie (författare)
-
- Ament-Velasquezi, Sandra Lorena (författare)
- Stockholms universitet,Zoologiska institutionen
-
- Kruys, Åsa, 1975- (författare)
- Uppsala universitet,Evolutionsmuseet
-
Hutchinson, Miriam I. (författare)
-
Powell, Amy Jo (författare)
-
Barry, Kerrie (författare)
-
Miller, Andrew N. (författare)
-
Grigoriev, Igor (författare)
-
Debuchy, Robert (författare)
-
Gladieux, Pierre (författare)
-
- Thorén, Markus Hiltunen (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för ekologi, miljö och botanik,The Royal Swedish Academy of Sciences, Sweden
-
- Johannesson, Hanna (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för ekologi, miljö och botanik,The Royal Swedish Academy of Sciences, Sweden
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier, 2023
- 2023
- Engelska.
-
Ingår i: Molecular Phylogenetics and Evolution. - : Elsevier. - 1055-7903 .- 1095-9513. ; 189
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The order Sordariales is taxonomically diverse, and harbours many species with different lifestyles and large economic importance. Despite its importance, a robust genome-scale phylogeny, and associated comparative genomic analysis of the order is lacking.In this study, we examined whole-genome data from 99 Sordariales, including 52 newly sequenced genomes, and seven outgroup taxa. We inferred a comprehensive phylogeny that resolved several contentious relationships amongst families in the order, and cleared-up intrafamily relationships within the Podosporaceae. Extensive comparative genomics showed that genomes from the three largest families in the dataset (Chae-tomiaceae, Podosporaceae and Sordariaceae) differ greatly in GC content, genome size, gene number, repeat percentage, evolutionary rate, and genome content affected by repeat-induced point mutations (RIP). All genomic traits showed phylogenetic signal, and ancestral state reconstruction revealed that the variation of the properties stems primarily from within-family evolution. Together, the results provide a thorough framework for understanding genome evolution in this important group of fungi.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Geovetenskap och miljövetenskap -- Miljövetenskap (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Earth and Related Environmental Sciences -- Environmental Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Whole-genome phylogeny
- Podosporaceae
- Chaetomiaceae
- Sordariaceae
- Genome evolution
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Hensen, Noah
-
Bonometti, Lucas
-
Westerberg, Ivar
-
Onuţ-Brännström, ...
-
Guillou, Sonia
-
Cros-Aarteil, Sa ...
-
visa fler...
-
Calhoun, Sara
-
Haridas, Sajeet
-
Kuo, Alan
-
Mondo, Stephen
-
Pangilinan, Jasm ...
-
Riley, Robert
-
Labutti, Kurt
-
Andreopoulos, Bi ...
-
Lipzen, Anna
-
Chen, Cindy
-
Yan, Mi
-
Daum, Chris
-
Ng, Vivian
-
Clum, Alicia
-
Steindorff, Andr ...
-
Ohm, Robin A.
-
Martin, Francis
-
Silar, Philippe
-
Natvig, Donald O ...
-
Lalanne, Christo ...
-
Gautier, Valerie
-
Ament-Velasquezi ...
-
Kruys, Åsa, 1975 ...
-
Hutchinson, Miri ...
-
Powell, Amy Jo
-
Barry, Kerrie
-
Miller, Andrew N ...
-
Grigoriev, Igor
-
Debuchy, Robert
-
Gladieux, Pierre
-
Thorén, Markus H ...
-
Johannesson, Han ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Geovetenskap och ...
-
och Miljövetenskap
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Evolutionsbiolog ...
- Artiklar i publikationen
-
Molecular Phylog ...
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet
-
Uppsala universitet