Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-229676" >
The single-cell tra...
-
Kokkinou, Efthymia
(författare)
The single-cell transcriptional landscape of innate and adaptive lymphocytes in pediatric-onset colitis
- Artikel/kapitelEngelska2023
Förlag, utgivningsår, omfång ...
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-229676
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-229676URI
-
https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2023.101038DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:153317933URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Innate lymphoid cells (ILCs) are considered innate counterparts of adaptive T cells; however, their common and unique transcriptional signatures in pediatric inflammatory bowel disease (pIBD) are largely unknown. Here, we report a dysregulated colonic ILC composition in pIBD colitis that correlates with inflammatory ac-tivity, including accumulation of naive-like CD45RA+CD62L- ILCs. Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) reveals modules of genes that are shared or unique across innate and adaptive lympho-cytes. Shared modules include genes associated with activation/tissue residency, naivety/quiescence, and antigen presentation. Lastly, nearest-neighbor-based analysis facilitates the identification of most in-flamedand least inflamedlymphocytes in pIBD colon with unique transcriptional signatures. Our study reveals shared and unique transcriptional signatures of colonic ILCs and T cells in pIBD. We also provide insight into the transcriptional regulation of colonic inflammation, deepening our understanding of the poten-tial mechanisms involved in pIBD.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Soini, TeaKarolinska Institutet
(författare)
-
Pandey, Ram Vinay
(författare)
-
van Acker, Aline
(författare)
-
Theorell, JakobKarolinska Institutet
(författare)
-
Czarnewski, Paulo,1991-Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)(Swepub:su)pacz1456
(författare)
-
Kvedaraite, EgleKarolinska Institutet
(författare)
-
Vandamme, Niels
(författare)
-
Lourda, MagdaKarolinska Institutet
(författare)
-
Sorini, ChiaraKarolinska Institutet
(författare)
-
Weigel, Whitney
(författare)
-
Carrasco, AnnaKarolinska Institutet
(författare)
-
Tibbitt, Christopher Andrew
(författare)
-
Schlums, HeinrichKarolinska Institutet
(författare)
-
Lindforss, UlrikKarolinska Institutet
(författare)
-
Nordenvall, CarolineKarolinska Institutet
(författare)
-
Ljunggren, MalinKarolinska Institutet
(författare)
-
Idestrom, Maja
(författare)
-
Svensson, MattiasKarolinska Institutet
(författare)
-
Henter, Jan-IngeKarolinska Institutet
(författare)
-
Villablanca, Eduardo J.Karolinska Institutet
(författare)
-
Bryceson, Yenan T.Karolinska Institutet
(författare)
-
Rolandsdotter, HelenaKarolinska Institutet
(författare)
-
Mjosberg, JennyKarolinska Institutet
(författare)
-
Karolinska InstitutetInstitutionen för biokemi och biofysik
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Cell reports medicine4:52666-3791
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Kokkinou, Efthym ...
-
Soini, Tea
-
Pandey, Ram Vina ...
-
van Acker, Aline
-
Theorell, Jakob
-
Czarnewski, Paul ...
-
visa fler...
-
Kvedaraite, Egle
-
Vandamme, Niels
-
Lourda, Magda
-
Sorini, Chiara
-
Weigel, Whitney
-
Carrasco, Anna
-
Tibbitt, Christo ...
-
Schlums, Heinric ...
-
Lindforss, Ulrik
-
Nordenvall, Caro ...
-
Ljunggren, Malin
-
Idestrom, Maja
-
Svensson, Mattia ...
-
Henter, Jan-Inge
-
Villablanca, Edu ...
-
Bryceson, Yenan ...
-
Rolandsdotter, H ...
-
Mjosberg, Jenny
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Immunologi inom ...
- Artiklar i publikationen
-
Cell reports med ...
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet
-
Karolinska Institutet