Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-70677" >
Cofactor mobility d...
Cofactor mobility determines reaction outcome in the IMPDH and GMPR (beta-alpha)(8) barrel enzymes
-
Patton, Gregory C. (författare)
-
- Stenmark, Pål (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
Gollapalli, Deviprasad R. (författare)
-
visa fler...
-
- Sevastik, Robin (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för organisk kemi
-
Kursula, Petri (författare)
-
Flodin, Susanne (författare)
-
Schuler, Herwig (författare)
-
Swales, Colin T. (författare)
-
- Eklund, Hans (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för molekylärbiologi,Department of Molecular Biology
-
- Himo, Fahmi (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för organisk kemi
-
Nordlund, Par (författare)
-
Hedstrom, Lizbeth (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
-
- 2011
- 2011
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Chemical Biology. - 1552-4450 .- 1552-4469. ; 7, s. 950-958
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://res.slu.se/i...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH) and guanosine monophosphate reductase (GMPR) belong to the same structural family, share a common set of catalytic residues and bind the same ligands. The structural and mechanistic features that determine reaction outcome in the IMPDH and GMPR family have not been identified. Here we show that the GMPR reaction uses the same intermediate E-XMP(star) as IMPDH, but in this reaction the intermediate reacts with ammonia instead of water. A single crystal structure of human GMPR type 2 with IMP and NADPH fortuitously captures three different states, each of which mimics a distinct step in the catalytic cycle of GMPR. The cofactor is found in two conformations: an 'in' conformation poised for hydride transfer and an 'out' conformation in which the cofactor is 6 angstrom from IMP. Mutagenesis along with substrate and cofactor analog experiments demonstrate that the out conformation is required for the deamination of GMP. Remarkably, the cofactor is part of the catalytic machinery that activates ammonia.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Strukturbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Structural Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Biochemistry
- biokemi
- strukturbiologi
- Structural Biology
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Patton, Gregory ...
-
Stenmark, Pål
-
Gollapalli, Devi ...
-
Sevastik, Robin
-
Kursula, Petri
-
Flodin, Susanne
-
visa fler...
-
Schuler, Herwig
-
Swales, Colin T.
-
Eklund, Hans
-
Himo, Fahmi
-
Nordlund, Par
-
Hedstrom, Lizbet ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Strukturbiologi
- Artiklar i publikationen
-
Nature Chemical ...
-
Cell Chemistry a ...
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet
-
Sveriges Lantbruksuniversitet