Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-11102" >
MASQOT-GUI :
-
Bylesjö, MaxUmeå universitet,Kemiska institutionen
(författare)
MASQOT-GUI : spot quality assessment for the two-channel microarray platform
- Artikel/kapitelEngelska2006
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2006-08-09
-
Oxford University Press (OUP),2006
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-11102
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-11102URI
-
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btl434DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
MASQOT-GUI provides an open-source, platform-independent software pipeline for two-channel microarray spot quality control. This includes gridding, segmentation, quantification, quality assessment and data visualization. It hosts a set of independent applications, with interactions between the tools as well as import and export support for external software. The implementation of automated multivariate quality control assessment, which is a unique feature of MASQOT-GUI, is based on the previously documented and evaluated MASQOT methodology. Further abilities of the application are outlined and illustrated. AVAILABILITY: MASQOT-GUI is Java-based and licensed under the GNU LGPL. Source code and installation files are available for download at http://masqot-gui.sourceforge.net/
Ämnesord och genrebeteckningar
-
NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
-
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
-
Computer Graphics
-
In Situ Hybridization; Fluorescence/instrumentation/methods/standards
-
Information Storage and Retrieval/*methods
-
Oligonucleotide Array Sequence Analysis/*instrumentation/*methods/standards
-
Quality Control
-
Software
-
Spectrometry; Fluorescence/instrumentation/*methods/standards
-
User-Computer Interface
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Sjödin, AndreasUmeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)anssjn96
(författare)
-
Eriksson, DanielUmeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)dalern99
(författare)
-
Antti, HenrikUmeå universitet,Kemiska institutionen(Swepub:umu)hean0004
(författare)
-
Moritz, ThomasUmeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC)
(författare)
-
Jansson, Stefan,1959-Umeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)stja0001
(författare)
-
Trygg, JohanUmeå universitet,Kemiska institutionen,Computational Life Science Cluster (CLiC)(Swepub:umu)jotr0001
(författare)
-
Umeå universitetKemiska institutionen
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Bioinformatics: Oxford University Press (OUP)22:20, s. 2554-25551367-48031367-4811
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas