Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-124226" >
A method to deciphe...
A method to decipher pleiotropy by detecting underlying heterogeneity driven by hidden subgroups applied to autoimmune and neuropsychiatric diseases
- Artikel/kapitelEngelska2016
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2016-05-16
-
Springer Science and Business Media LLC,2016
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-124226
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-124226URI
-
https://doi.org/10.1038/ng.3572DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:133834123URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
There is growing evidence of shared risk alleles for complex traits (pleiotropy), including autoimmune and neuropsychiatric diseases. This might be due to sharing among all individuals (whole-group pleiotropy) or a subset of individuals in a genetically heterogeneous cohort (subgroup heterogeneity). Here we describe the use of a well-powered statistic, BUHMBOX, to distinguish between those two situations using genotype data. We observed a shared genetic basis for 11 autoimmune diseases and type 1 diabetes (T1D; P < 1 x 10(-4)) and for 11 autoimmune diseases and rheumatoid arthritis (RA; P < 1 x 10(-3)). This sharing was not explained by subgroup heterogeneity (corrected P-BUHMBOX > 0.2; 6,670 T1D cases and 7,279 RA cases). Genetic sharing between seronegative and seropostive RA (P < 1 x 10(-9)) had significant evidence of subgroup heterogeneity, suggesting a subgroup of seropositive-like cases within seronegative cases (P-BUHMBOX = 0.008; 2,406 seronegative RA cases). We also observed a shared genetic basis for major depressive disorder (MDD) and schizophrenia (P < 1 x 10(-4)) that was not explained by subgroup heterogeneity (P-BUHMBOX = 0.28; 9,238 MDD cases).
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Pouget, Jennie G.
(författare)
-
Slowikowski, Kamil
(författare)
-
Stahl, Eli
(författare)
-
Lee, Cue Hyunkyu
(författare)
-
Diogo, Dorothee
(författare)
-
Hu, Xinli
(författare)
-
Park, Yu Rang
(författare)
-
Kim, Eunji
(författare)
-
Gregersen, Peter K.
(författare)
-
Dahlqvist, Solbritt RantapääUmeå universitet,Reumatologi(Swepub:umu)sora0001
(författare)
-
Worthington, Jane
(författare)
-
Martin, Javier
(författare)
-
Eyre, Steve
(författare)
-
Klareskog, LarsKarolinska Institutet
(författare)
-
Huizinga, Tom
(författare)
-
Chen, Wei-Min
(författare)
-
Onengut-Gumuscu, Suna
(författare)
-
Rich, Stephen S.
(författare)
-
Wray, Naomi R.
(författare)
-
Raychaudhuri, Soumya
(författare)
-
Umeå universitetReumatologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Genetics: Springer Science and Business Media LLC48:7, s. 803-+1061-40361546-1718
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Han, Buhm
-
Pouget, Jennie G ...
-
Slowikowski, Kam ...
-
Stahl, Eli
-
Lee, Cue Hyunkyu
-
Diogo, Dorothee
-
visa fler...
-
Hu, Xinli
-
Park, Yu Rang
-
Kim, Eunji
-
Gregersen, Peter ...
-
Dahlqvist, Solbr ...
-
Worthington, Jan ...
-
Martin, Javier
-
Eyre, Steve
-
Klareskog, Lars
-
Huizinga, Tom
-
Chen, Wei-Min
-
Onengut-Gumuscu, ...
-
Rich, Stephen S.
-
Wray, Naomi R.
-
Raychaudhuri, So ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Genetics
- Av lärosätet
-
Umeå universitet
-
Karolinska Institutet