Loss of ncm5 and mcm5 wobble uridine side chains results in an altered metabolic profile

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-125635" > Loss of ncm5 and mc...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Loss of ncm5 and mcm5 wobble uridine side chains results in an altered metabolic profile

Karlsborn, Tony, 1987- (författare): Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet),Anders Byström

Mahmud, A K M Firoj (författare): Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet),Maria Fällman

Tükenmez, Hasan, 1987- (författare): Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet),Anders Byström

visa fler...

Byström, Anders S. (författare): Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Teknisk-naturvetenskaplig fakultet),Anders Byström

visa färre...

(creator_code:org_t)

2016-09-27
2016
Engelska.
Ingår i: Metabolomics. - : Springer. - 1573-3882 .- 1573-3890. ; 12:12

Relaterad länk:: https://doi.org/10.1...; visa fler...; https://umu.diva-por... (primary) (Raw object); https://link.springe...; https://urn.kb.se/re...; https://doi.org/10.1...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

Introduction: The Elongator complex, comprising six subunits (Elp1p-Elp6p), is required for formation of 5-carbamoylmethyl (ncm(5)) and 5-methoxycarbonylmethyl (mcm(5)) side chains on wobble uridines in 11 out of 42 tRNA species in Saccharomyces cerevisiae. Loss of these side chains reduces the efficiency of tRNA decoding during translation, resulting in pleiotropic phenotypes. Overexpression of hypomodified tRNA(s2UUU)(Lys); tRNA(s2UUG)(Gln) and tRNA(s2UUC)(Glu), which in wild-type strains are modified with mcm(5)s(2)U, partially suppress phenotypes of an elp3 Delta strain. Objectives: To identify metabolic alterations in an elp3 Delta strain and elucidate whether these metabolic alterations are suppressed by overexpression of hypomodified tRNA(s2UUU)(Lys); tRNA(s2UUG)(Gln) and tRNA(s2UUC)(Glu). Method: Metabolic profiles were obtained using untargeted GC-TOF-MS of a temperature-sensitive elp3 Delta strain carrying either an empty low-copy vector, an empty high-copy vector, a low-copy vector harboring the wild-type ELP3 gene, or a high-copy vector overexpressing tRNA(s2UUU)(Lys); tRNA(s2UUG)(Gln) and tRNA(s2UUC)(Glu). The temperature sensitive elp3 Delta strain derivatives were cultivated at permissive (30 degrees C) or semi-permissive (34 degrees C) growth conditions. Results: Culturing an elp3 Delta strain at 30 or 34 degrees C resulted in altered metabolism of 36 and 46 %, respectively, of all metabolites detected when compared to an elp3D strain carrying the wild-type ELP3 gene. Overexpression of hypomodified tRNA(s2UUU)(Lys); tRNA(s2UUG)(Gln) and tRNA(s2UUC)(Glu) suppressed a subset of the metabolic alterations observed in the elp3 Delta strain. Conclusion: Our results suggest that the presence of ncm(5)- and mcm(5)-side chains on wobble uridines in tRNA are important for metabolic homeostasis.

Ämnesord

NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)

Nyckelord

Elongator complex
tRNA wobble uridine modifications
Translation
ELP3
Metabolomics
Metabolic profiling
molekylärbiologi
Molecular Biology

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Metabolomics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Karlsborn, Tony, ...; Mahmud, A K M Fi ...; Tükenmez, Hasan, ...; Byström, Anders ...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biokemi och mole ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Endokrinologi oc ...

Artiklar i publikationen: Metabolomics

Av lärosätet: Umeå universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se