Pfh1 Is an Accessory Replicative Helicase that Interacts with the Replisome to Facilitate Fork Progression and Preserve Genome Integrity

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-125854" > Pfh1 Is an Accessor...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

McDonald, Karin R. (författare)

Pfh1 Is an Accessory Replicative Helicase that Interacts with the Replisome to Facilitate Fork Progression and Preserve Genome Integrity

Artikel/kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2016-09-09
Copernicus GmbH,2016
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-125854
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-125854URI
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006238DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Replicative DNA helicases expose the two strands of the double helix to the replication apparatus, but accessory helicases are often needed to help forks move past naturally occurring hard-to-replicate sites, such as tightly bound proteins, RNA/DNA hybrids, and DNA secondary structures. Although the Schizosaccharomyces pombe 5'-to-3' DNA helicase Pfh1 is known to promote fork progression, its genomic targets, dynamics, and mechanisms of action are largely unknown. Here we address these questions by integrating genome-wide identification of Pfh1 binding sites, comprehensive analysis of the effects of Pfh1 depletion on replication and DNA damage, and proteomic analysis of Pfh1 interaction partners by immunoaffinity purification mass spectrometry. Of the 621 high confidence Pfh1-binding sites in wild type cells, about 40% were sites of fork slowing (as marked by high DNA polymerase occupancy) and/or DNA damage (as marked by high levels of phosphorylated H2A). The replication and integrity of tRNA and 5S rRNA genes, highly transcribed RNA polymerase II genes, and nucleosome depleted regions were particularly Pfh1-dependent. The association of Pfh1 with genomic integrity at highly transcribed genes was S phase dependent, and thus unlikely to be an artifact of high transcription rates. Although Pfh1 affected replication and suppressed DNA damage at discrete sites throughout the genome, Pfh1 and the replicative DNA polymerase bound to similar extents to both Pfh1-dependent and independent sites, suggesting that Pfh1 is proximal to the replication machinery during S phase. Consistent with this interpretation, Pfh1 co-purified with many key replisome components, including the hexameric MCM helicase, replicative DNA polymerases, RPA, and the processivity clamp PCNA in an S phase dependent manner. Thus, we conclude that Pfh1 is an accessory DNA helicase that interacts with the replisome and promotes replication and suppresses DNA damage at hard-to-replicate sites. These data provide insight into mechanisms by which this evolutionarily conserved helicase helps preserve genome integrity.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Guise, Amanda J. (författare)
Pourbozorgi-Langroudi, ParhamUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik(Swepub:umu)papo0009 (författare)
Cristea, Ileana M. (författare)
Zakian, Virginia A. (författare)
Capra, John A. (författare)
Sabouri, NasimUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik(Swepub:umu)namsai01 (författare)
Umeå universitetInstitutionen för medicinsk kemi och biofysik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:PLOS Genetics: Copernicus GmbH12:91553-73901553-7404

Internetlänk

Hitta via bibliotek

PLOS Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: McDonald, Karin ...; Guise, Amanda J.; Pourbozorgi-Lang ...; Cristea, Ileana ...; Zakian, Virginia ...; Capra, John A.; visa fler...; Sabouri, Nasim; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Andra medicinska ...

Artiklar i publikationen: PLOS Genetics

Av lärosätet: Umeå universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se