Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-130086" >
Improved bi-allelic...
-
Eggenschwiler, Reto
(författare)
Improved bi-allelic modification of a transcriptionally silent locus in patient-derived iPSC by Cas9 nickase
- Artikel/kapitelEngelska2016
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2016-12-02
-
Nature Publishing Group,2016
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-130086
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-130086URI
-
https://doi.org/10.1038/srep38198DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:134733211URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Homology directed repair (HDR)-based genome editing via selectable long flanking arm donors can be hampered by local transgene silencing at transcriptionally silent loci. Here, we report efficient bi-allelic modification of a silent locus in patient-derived hiPSC by using Cas9 nickase and a silencing-resistant donor construct that contains an excisable selection/counter-selection cassette. To identify the most active single guide RNA (sgRNA)/nickase combinations, we employed a lentiviral vector-based reporter assay to determine the HDR efficiencies in cella. Next, we used the most efficient pair of sgRNAs for targeted integration of an improved, silencing-resistant plasmid donor harboring a piggyBac-flanked puro Delta tk cassette. Moreover, we took advantage of a dual-fluorescence selection strategy for bi-allelic targeting and achieved 100% counter-selection efficiency after bi-allelic excision of the selection/counter-selection cassette. Together, we present an improved system for efficient bi-allelic modification of transcriptionally silent loci in human pluripotent stem cells.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Moslem, Mohsen
(författare)
-
Fráguas, Mariane Serra
(författare)
-
Galla, Melanie
(författare)
-
Papp, Oliver
(författare)
-
Naujock, Maximilian
(författare)
-
Fonfara, InesUmeå universitet,Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS),Umeå Centre for Microbial Research (UCMR),Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten),Max Planck Institute for Infection Biology, Department of Regulation in Infection Biology, Berlin, Germany(Swepub:umu)info0028
(författare)
-
Gensch, Ingrid
(författare)
-
Wähner, Annabell
(författare)
-
Beh-Pajooh, Abbas
(författare)
-
Mussolino, Claudio
(författare)
-
Tauscher, Marcel
(författare)
-
Steinemann, Doris
(författare)
-
Wegner, Florian
(författare)
-
Petri, Susanne
(författare)
-
Schambach, Axel
(författare)
-
Charpentier, EmmanuelleUmeå universitet,Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS),Umeå Centre for Microbial Research (UCMR),Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten)(Swepub:umu)emch0006
(författare)
-
Cathomen, Toni
(författare)
-
Cantz, Tobias
(författare)
-
Umeå universitetMolekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Scientific Reports: Nature Publishing Group62045-2322
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Eggenschwiler, R ...
-
Moslem, Mohsen
-
Fráguas, Mariane ...
-
Galla, Melanie
-
Papp, Oliver
-
Naujock, Maximil ...
-
visa fler...
-
Fonfara, Ines
-
Gensch, Ingrid
-
Wähner, Annabell
-
Beh-Pajooh, Abba ...
-
Mussolino, Claud ...
-
Tauscher, Marcel
-
Steinemann, Dori ...
-
Wegner, Florian
-
Petri, Susanne
-
Schambach, Axel
-
Charpentier, Emm ...
-
Cathomen, Toni
-
Cantz, Tobias
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
- Artiklar i publikationen
-
Scientific Repor ...
- Av lärosätet
-
Umeå universitet
-
Karolinska Institutet