Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-13238" >
Efficient mapping o...
-
Karlsson, Elinor K.
(författare)
Efficient mapping of mendelian traits in dogs through genome-wide association
- Artikel/kapitelEngelska2007
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2007-09-30
-
Springer Science and Business Media LLC,2007
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-13238
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-13238URI
-
https://doi.org/10.1038/ng.2007.10DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
With several hundred genetic diseases and an advantageous genome structure, dogs are ideal for mapping genes that cause disease. Here we report the development of a genotyping array with |[sim]|27,000 SNPs and show that genome-wide association mapping of mendelian traits in dog breeds can be achieved with only |[sim]|20 dogs. Specifically, we map two traits with mendelian inheritance: the major white spotting (S) locus and the hair ridge in Rhodesian ridgebacks. For both traits, we map the loci to discrete regions of <1 Mb. Fine-mapping of the S locus in two breeds refines the localization to a region of |[sim]|100 kb contained within the pigmentation-related gene MITF. Complete sequencing of the white and solid haplotypes identifies candidate regulatory mutations in the melanocyte-specific promoter of MITF. Our results show that genome-wide association mapping within dog breeds, followed by fine-mapping across multiple breeds, will be highly efficient and generally applicable to trait mapping, providing insights into canine and human health.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Baranowska, Izabella
(författare)
-
Wade, Claire M.
(författare)
-
Salmon Hillbertz, Nicolette H. C.Department of Animal Breeding and Genetics, Swedish University of Agricultural Sciences, Uppsala, Sweden(Swepub:uu)nishi838
(författare)
-
Zody, Michael C.
(författare)
-
Anderson, Nathan
(författare)
-
Biagi, Tara M.
(författare)
-
Patterson, Nick
(författare)
-
Pielberg, Gerli RosengrenUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)gepie020
(författare)
-
Kulbokas, Edward J.
(författare)
-
Comstock, Kenine E.
(författare)
-
Keller, Evan T.
(författare)
-
Mesirov, Jill P.
(författare)
-
von Euler, Henrik
(författare)
-
Kämpe, OlleUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Autoimmuna sjukdomar (Kämpe)(Swepub:uu)ollekamp
(författare)
-
Hedhammar, Åke
(författare)
-
Lander, Eric S.
(författare)
-
Andersson, Göran
(författare)
-
Andersson, LeifUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)leand227
(författare)
-
Lindblad-Toh, KerstinUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)kerli865
(författare)
-
Department of Animal Breeding and Genetics, Swedish University of Agricultural Sciences, Uppsala, SwedenInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Genetics: Springer Science and Business Media LLC39:11, s. 1321-13281061-40361546-1718
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Karlsson, Elinor ...
-
Baranowska, Izab ...
-
Wade, Claire M.
-
Salmon Hillbertz ...
-
Zody, Michael C.
-
Anderson, Nathan
-
visa fler...
-
Biagi, Tara M.
-
Patterson, Nick
-
Pielberg, Gerli ...
-
Kulbokas, Edward ...
-
Comstock, Kenine ...
-
Keller, Evan T.
-
Mesirov, Jill P.
-
von Euler, Henri ...
-
Kämpe, Olle
-
Hedhammar, Åke
-
Lander, Eric S.
-
Andersson, Göran
-
Andersson, Leif
-
Lindblad-Toh, Ke ...
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Genetics
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet