Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-135341" >
Thermodynamic Chara...
Thermodynamic Characterization of ppGpp Binding to EF-G or 1F2 and of Initiator tRNA Binding to Free 1F2 in the Presence of GDP, GTP, or ppGpp
-
Mitkevich, Vladimir A. (författare)
-
Ermakov, Andrey (författare)
-
Kulikova, Alexandra A. (författare)
-
visa fler...
-
- Tankov, Stoyan (författare)
- Uppsala universitet,Molekylärbiologi
-
Shyp, Viktoriya (författare)
-
Soosaar, Aksel (författare)
-
Tenson, Tanel (författare)
-
Makarov, Alexander A. (författare)
-
- Ehrenberg, Måns (författare)
- Uppsala universitet,Molekylärbiologi
-
Hauryliuk, Vasili (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2010
- 2010
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Molecular Biology. - : Elsevier BV. - 0022-2836 .- 1089-8638. ; 402:5, s. 838-846
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- In addition to their natural substrates GDP and GTP, the bacterial translational GTPases initiation factor (IF) 2 and elongation factor G (EF-G) interact with the alarmone molecule guanosine tetraphosphate (ppGpp), which leads to GTPase inhibition. We have used isothermal titration calorimetry to determine the affinities of ppGpp for IF2 and EF-G at a temperature interval of 5-25 degrees C. We find that ppGpp has a higher affinity for IF2 than for EF-G (1.7-2.8 Q mu M K-d versus 9.1-13.9 mu M K-d at 10-25 degrees C), suggesting that during stringent response in vivo, IF2 is more responsive to ppGpp than to EF-G. We investigated the effects of ppGpp, GDP, and GTP on IF2 interactions with fMet-tRNA(fMet) demonstrating that IF2 binds to initiator tRNA with submicromolar K-d and that affinity is altered by the G nucleotides only slightly. This-in conjunction with earlier reports on IF2 interactions with fMet-tRNA(fMet) in the context of the 30S initiation complex, where ppGpp was suggested to strongly inhibit fMet-tRNA(fMet) binding and GTP was suggested to strongly promote fMet-tRNA(fMet) binding-sheds new light on the mechanisms of the G-nucleotide-regulated fMet-tRNA(fMet) selection.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- IF2
- EF-G
- PPGPP
- initiator tRNA
- ITC
- Molecular biology
- Molekylärbiologi
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Mitkevich, Vladi ...
-
Ermakov, Andrey
-
Kulikova, Alexan ...
-
Tankov, Stoyan
-
Shyp, Viktoriya
-
Soosaar, Aksel
-
visa fler...
-
Tenson, Tanel
-
Makarov, Alexand ...
-
Ehrenberg, Måns
-
Hauryliuk, Vasil ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Molec ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet