Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-137747" >
Global and unbiased...
Global and unbiased detection of splice junctions from RNA-seq data
-
- Ameur, Adam (författare)
- Uppsala universitet,Genomik
-
- Wetterbom, Anna (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi
-
- Feuk, Lars (författare)
- Uppsala universitet,Genomik
-
visa fler...
-
- Gyllensten, Ulf (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Springer Science and Business Media LLC, 2010
- 2010
- Engelska.
-
Ingår i: Genome Biology. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1474-760X .- 1465-6906. ; 11:3, s. R34-
- Relaterad länk:
-
https://genomebiolog...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- We have developed a new strategy for de novo prediction of splice junctions in short-read RNA-seq data, suitable for detection of novel splicing events and chimeric transcripts. When tested on mouse RNA-seq data, > 31,000 splice events were predicted, of which 88% bridged between two regions separated by <= 100 kb, and 74% connected two exons of the same RefSeq gene. Our method also reports genomic rearrangements such as insertions and deletions.
Nyckelord
- MEDICINE
- MEDICIN
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas