SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-153226"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-153226" > Differential Geneti...

  • Chung, Sharon A. (författare)

Differential Genetic Associations for Systemic Lupus Erythematosus Based on Anti-dsDNA Autoantibody Production

  • Artikel/kapitelEngelska2011

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2011-03-03
  • Public Library of Science (PLoS),2011
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-153226
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-153226URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1001323DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Systemic lupus erythematosus (SLE) is a clinically heterogeneous, systemic autoimmune disease characterized by autoantibody formation. Previously published genome-wide association studies (GWAS) have investigated SLE as a single phenotype. Therefore, we conducted a GWAS to identify genetic factors associated with anti-dsDNA autoantibody production, a SLE-related autoantibody with diagnostic and clinical importance. Using two independent datasets, over 400,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were studied in a total of 1,717 SLE cases and 4,813 healthy controls. Anti-dsDNA autoantibody positive (anti-dsDNA +, n = 811) and anti-dsDNA autoantibody negative (anti-dsDNA -, n = 906) SLE cases were compared to healthy controls and to each other to identify SNPs associated specifically with these SLE subtypes. SNPs in the previously identified SLE susceptibility loci STAT4, IRF5, ITGAM, and the major histocompatibility complex were strongly associated with anti-dsDNA + SLE. Far fewer and weaker associations were observed for anti-dsDNA - SLE. For example, rs7574865 in STAT4 had an OR for anti-dsDNA + SLE of 1.77 (95% CI 1.57-1.99, p = 2.0E-20) compared to an OR for anti-dsDNA - SLE of 1.26 (95% CI 1.12-1.41, p = 2.4E-04), with (Pheterogeneity)<0.0005. SNPs in the SLE susceptibility loci BANK1, KIAA1542, and UBE2L3 showed evidence of association with anti-dsDNA + SLE and were not associated with anti-dsDNA - SLE. In conclusion, we identified differential genetic associations with SLE based on anti-dsDNA autoantibody production. Many previously identified SLE susceptibility loci may confer disease risk through their role in autoantibody production and be more accurately described as autoantibody propensity loci. Lack of strong SNP associations may suggest that other types of genetic variation or non-genetic factors such as environmental exposures have a greater impact on susceptibility to anti-dsDNA - SLE.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • MEDICINE
  • MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Taylor, Kimberly E. (författare)
  • Graham, Robert R. (författare)
  • Nititham, Joanne (författare)
  • Lee, Annette T. (författare)
  • Ortmann, Ward A. (författare)
  • Jacob, Chaim O. (författare)
  • Alarcon-Riquelme, Marta E.Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)martaala (författare)
  • Tsao, Betty P. (författare)
  • Harley, John B. (författare)
  • Gaffney, Patrick M. (författare)
  • Moser, Kathy L. (författare)
  • Petri, Michelle (författare)
  • Demirci, F. Yesim (författare)
  • Kamboh, M. Ilyas (författare)
  • Manzi, Susan (författare)
  • Gregersen, Peter K. (författare)
  • Langefeld, Carl D. (författare)
  • Behrens, Timothy W. (författare)
  • Criswell, Lindsey A. (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för immunologi, genetik och patologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLoS Genetics: Public Library of Science (PLoS)7:3, s. e1001323-1553-73901553-7404

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy