SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-154885"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-154885" > A Comprehensive Eva...

  • Obeidat, Ma'en (författare)

A Comprehensive Evaluation of Potential Lung Function Associated Genes in the SpiroMeta General Population Sample

  • Artikel/kapitelEngelska2011

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2011-05-20
  • Public Library of Science (PLoS),2011
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-154885
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-154885URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pone.0019382DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Rationale: Lung function measures are heritable traits that predict population morbidity and mortality and are essential for the diagnosis of chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Variations in many genes have been reported to affect these traits, but attempts at replication have provided conflicting results. Recently, we undertook a meta-analysis of Genome Wide Association Study (GWAS) results for lung function measures in 20,288 individuals from the general population (the SpiroMeta consortium). Objectives: To comprehensively analyse previously reported genetic associations with lung function measures, and to investigate whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in these genomic regions are associated with lung function in a large population sample. Methods: We analysed association for SNPs tagging 130 genes and 48 intergenic regions (+/-10 kb), after conducting a systematic review of the literature in the PubMed database for genetic association studies reporting lung function associations. Results: The analysis included 16,936 genotyped and imputed SNPs. No loci showed overall significant association for FEV1 or FEV1/FVC traits using a carefully defined significance threshold of 1.3 x 10(-5). The most significant loci associated with FEV1 include SNPs tagging MACROD2 (P = 6.81 x 10(-5)), CNTN5 (P = 4.37 x 10(-4)), and TRPV4 (P = 1.58 x 10(-3)). Among ever-smokers, SERPINA1 showed the most significant association with FEV1 (P = 8.41 x 10(-5)), followed by PDE4D (P = 1.22 x 10(-4)). The strongest association with FEV1/FVC ratio was observed with ABCC1 (P = 4.38 x 10(-4)), and ESR1 (P = 5.42 x 10(-4)) among ever-smokers. Conclusions: Polymorphisms spanning previously associated lung function genes did not show strong evidence for association with lung function measures in the SpiroMeta consortium population. Common SERPINA1 polymorphisms may affect FEV1 among smokers in the general population.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • MEDICINE
  • MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Wain, Louise V. (författare)
  • Shrine, Nick (författare)
  • Kalsheker, Noor (författare)
  • Artigas, Maria Soler (författare)
  • Repapi, Emmanouela (författare)
  • Burton, Paul R. (författare)
  • Johnson, Toby (författare)
  • Ramasamy, Adaikalavan (författare)
  • Zhao, Jing Hua (författare)
  • Zhai, Guangju (författare)
  • Huffman, Jennifer E. (författare)
  • Vitart, Veronique (författare)
  • Albrecht, Eva (författare)
  • Igl, WilmarUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi (författare)
  • Hartikainen, Anna-Liisa (författare)
  • Pouta, Anneli (författare)
  • Cadby, Gemma (författare)
  • Hui, Jennie (författare)
  • Palmer, Lyle J. (författare)
  • Hadley, David (författare)
  • McArdle, Wendy L. (författare)
  • Rudnicka, Alicja R. (författare)
  • Barroso, Ines (författare)
  • Loos, Ruth J. F. (författare)
  • Wareham, Nicholas J. (författare)
  • Mangino, Massimo (författare)
  • Soranzo, Nicole (författare)
  • Spector, Tim D. (författare)
  • Glaeser, Sven (författare)
  • Homuth, Georg (författare)
  • Voelzke, Henry (författare)
  • Deloukas, Panos (författare)
  • Granell, Raquel (författare)
  • Henderson, John (författare)
  • Grkovic, Ivica (författare)
  • Jankovic, Stipan (författare)
  • Zgaga, Lina (författare)
  • Polasek, Ozren (författare)
  • Rudan, Igor (författare)
  • Wright, Alan F. (författare)
  • Campbell, Harry (författare)
  • Wild, Sarah H. (författare)
  • Wilson, James F. (författare)
  • Heinrich, Joachim (författare)
  • Imboden, Medea (författare)
  • Probst-Hensch, Nicole M. (författare)
  • Gyllensten, UlfUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)ulfgyll (författare)
  • Johansson, ÅsaUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)asjoh108 (författare)
  • Zaboli, GhazalUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi (författare)
  • Mustelin, Linda (författare)
  • Rantanen, Taina (författare)
  • Surakka, Ida (författare)
  • Kaprio, Jaakko (författare)
  • Jarvelin, Marjo-Riitta (författare)
  • Hayward, Caroline (författare)
  • Evans, David M. (författare)
  • Koch, Beate (författare)
  • Musk, Arthur William (författare)
  • Elliott, Paul (författare)
  • Strachan, David P. (författare)
  • Tobin, Martin D. (författare)
  • Sayers, Ian (författare)
  • Hall, Ian P. (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för genetik och patologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLOS ONE: Public Library of Science (PLoS)6:5, s. e19382-1932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • PLOS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy