Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-158302" >
Targeted resequenci...
-
Albert, F. W.
(författare)
Targeted resequencing of a genomic region influencing tameness and aggression reveals multiple signals of positive selection
- Artikel/kapitelEngelska2011
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2011-02-09
-
Springer Science and Business Media LLC,2011
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-158302
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-158302URI
-
https://doi.org/10.1038/hdy.2011.4DOI
-
https://res.slu.se/id/publ/59421URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
The identification of the causative genetic variants in quantitative trait loci (QTL) influencing phenotypic traits is challenging, especially in crosses between outbred strains. We have previously identified several QTL influencing tameness and aggression in a cross between two lines of wild-derived, outbred rats (Rattus norvegicus) selected for their behavior towards humans. Here, we use targeted sequence capture and massively parallel sequencing of all genes in the strongest QTL in the founder animals of the cross. We identify many novel sequence variants, several of which are potentially functionally relevant. The QTL contains several regions where either the tame or the aggressive founders contain no sequence variation, and two regions where alternative haplotypes are fixed between the founders. A re-analysis of the QTL signal showed that the causative site is likely to be fixed among the tame founder animals, but that several causative alleles may segregate among the aggressive founder animals. Using a formal test for the detection of positive selection, we find 10 putative positively selected regions, some of which are close to genes known to influence behavior. Together, these results show that the QTL is probably not caused by a single selected site, but may instead represent the joint effects of several sites that were targets of polygenic selection.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Hodges, E.
(författare)
-
Jensen, J. D.
(författare)
-
Besnier, FrancoisSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics(Swepub:slu)52254
(författare)
-
Xuan, Z.
(författare)
-
Rooks, M.
(författare)
-
Bhattacharjee, A.
(författare)
-
Brizuela, L.
(författare)
-
Good, J. M.
(författare)
-
Green, R. E.
(författare)
-
Burbano, H. A.
(författare)
-
Plyusnina, I. Z.
(författare)
-
Trut, L.
(författare)
-
Andersson, LeifUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)jacohogl
(författare)
-
Schoeneberg, T.
(författare)
-
Carlborg, ÖrjanSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics,Swedish University of Agricultural Sciences, Uppsala, Sweden(Swepub:slu)48083
(författare)
-
Hannon, G. J.
(författare)
-
Pääbo, SvanteUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
(författare)
-
Sveriges lantbruksuniversitetInstitutionen för husdjursgenetik (HGEN)
(creator_code:org_t)
-
Sveriges lantbruksuniversitet
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Heredity: Springer Science and Business Media LLC107:3, s. 205-2140018-067X1365-2540
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
Heredity
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Albert, F. W.
-
Hodges, E.
-
Jensen, J. D.
-
Besnier, Francoi ...
-
Xuan, Z.
-
Rooks, M.
-
visa fler...
-
Bhattacharjee, A ...
-
Brizuela, L.
-
Good, J. M.
-
Green, R. E.
-
Burbano, H. A.
-
Plyusnina, I. Z.
-
Trut, L.
-
Andersson, Leif
-
Schoeneberg, T.
-
Carlborg, Örjan
-
Hannon, G. J.
-
Pääbo, Svante
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- LANTBRUKSVETENSKAPER
-
LANTBRUKSVETENSK ...
-
och Veterinärmedicin
-
- LANTBRUKSVETENSKAPER
-
LANTBRUKSVETENSK ...
-
och Husdjursvetenska ...
- Artiklar i publikationen
-
Heredity
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Sveriges Lantbruksuniversitet