Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-161456" >
A high-resolution m...
-
Lindblad-Toh, KerstinUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
(författare)
A high-resolution map of human evolutionary constraint using 29 mammals
- Artikel/kapitelEngelska2011
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2011-10-12
-
Springer Science and Business Media LLC,2011
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-161456
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-161456URI
-
https://doi.org/10.1038/nature10530DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
The comparison of related genomes has emerged as a powerful lens for genome interpretation. Here we report the sequencing and comparative analysis of 29 eutherian genomes. We confirm that at least 5.5% of the human genome has undergone purifying selection, and locate constrained elements covering similar to 4.2% of the genome. We use evolutionary signatures and comparisons with experimental data sets to suggest candidate functions for similar to 60% of constrained bases. These elements reveal a small number of new coding exons, candidate stop codon readthrough events and over 10,000 regions of overlapping synonymous constraint within protein-coding exons. We find 220 candidate RNA structural families, and nearly a million elements overlapping potential promoter, enhancer and insulator regions. We report specific amino acid residues that have undergone positive selection, 280,000 non-coding elements exapted from mobile elements and more than 1,000 primate-and human-accelerated elements. Overlap with disease-associated variants indicates that our findings will be relevant for studies of human biology, health and disease.
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Garber, Manuel
(författare)
-
Zuk, Or
(författare)
-
Lin, Michael F.
(författare)
-
Parker, Brian J.
(författare)
-
Washietl, Stefan
(författare)
-
Kheradpour, Pouya
(författare)
-
Ernst, Jason
(författare)
-
Jordan, Gregory
(författare)
-
Mauceli, Evan
(författare)
-
Ward, Lucas D.
(författare)
-
Lowe, Craig B.
(författare)
-
Holloway, Alisha K.
(författare)
-
Clamp, Michele
(författare)
-
Gnerre, Sante
(författare)
-
Alfoeldi, Jessica
(författare)
-
Beal, Kathryn
(författare)
-
Chang, Jean
(författare)
-
Clawson, Hiram
(författare)
-
Cuff, James
(författare)
-
Di Palma, Federica
(författare)
-
Fitzgerald, Stephen
(författare)
-
Flicek, Paul
(författare)
-
Guttman, Mitchell
(författare)
-
Hubisz, Melissa J.
(författare)
-
Jaffe, David B.
(författare)
-
Jungreis, Irwin
(författare)
-
Kent, W. James
(författare)
-
Kostka, Dennis
(författare)
-
Lara, Marcia
(författare)
-
Martins, Andre L.
(författare)
-
Massingham, Tim
(författare)
-
Moltke, Ida
(författare)
-
Raney, Brian J.
(författare)
-
Rasmussen, Matthew D.
(författare)
-
Robinson, Jim
(författare)
-
Stark, Alexander
(författare)
-
Vilella, Albert J.
(författare)
-
Wen, Jiayu
(författare)
-
Xie, Xiaohui
(författare)
-
Zody, Michael C.
(författare)
-
Worley, Kim C.
(författare)
-
Kovar, Christie L.
(författare)
-
Muzny, Donna M.
(författare)
-
Gibbs, Richard A.
(författare)
-
Warren, Wesley C.
(författare)
-
Mardis, Elaine R.
(författare)
-
Weinstock, George M.
(författare)
-
Wilson, Richard K.
(författare)
-
Birney, Ewan
(författare)
-
Margulies, Elliott H.
(författare)
-
Herrero, Javier
(författare)
-
Green, Eric D.
(författare)
-
Haussler, David
(författare)
-
Siepel, Adam
(författare)
-
Goldman, Nick
(författare)
-
Pollard, Katherine S.
(författare)
-
Pedersen, Jakob S.
(författare)
-
Lander, Eric S.
(författare)
-
Kellis, Manolis
(författare)
-
Uppsala universitetInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature: Springer Science and Business Media LLC478:7370, s. 476-4820028-08361476-4687
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
Nature
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Lindblad-Toh, Ke ...
-
Garber, Manuel
-
Zuk, Or
-
Lin, Michael F.
-
Parker, Brian J.
-
Washietl, Stefan
-
visa fler...
-
Kheradpour, Pouy ...
-
Ernst, Jason
-
Jordan, Gregory
-
Mauceli, Evan
-
Ward, Lucas D.
-
Lowe, Craig B.
-
Holloway, Alisha ...
-
Clamp, Michele
-
Gnerre, Sante
-
Alfoeldi, Jessic ...
-
Beal, Kathryn
-
Chang, Jean
-
Clawson, Hiram
-
Cuff, James
-
Di Palma, Federi ...
-
Fitzgerald, Step ...
-
Flicek, Paul
-
Guttman, Mitchel ...
-
Hubisz, Melissa ...
-
Jaffe, David B.
-
Jungreis, Irwin
-
Kent, W. James
-
Kostka, Dennis
-
Lara, Marcia
-
Martins, Andre L ...
-
Massingham, Tim
-
Moltke, Ida
-
Raney, Brian J.
-
Rasmussen, Matth ...
-
Robinson, Jim
-
Stark, Alexander
-
Vilella, Albert ...
-
Wen, Jiayu
-
Xie, Xiaohui
-
Zody, Michael C.
-
Worley, Kim C.
-
Kovar, Christie ...
-
Muzny, Donna M.
-
Gibbs, Richard A ...
-
Warren, Wesley C ...
-
Mardis, Elaine R ...
-
Weinstock, Georg ...
-
Wilson, Richard ...
-
Birney, Ewan
-
Margulies, Ellio ...
-
Herrero, Javier
-
Green, Eric D.
-
Haussler, David
-
Siepel, Adam
-
Goldman, Nick
-
Pollard, Katheri ...
-
Pedersen, Jakob ...
-
Lander, Eric S.
-
Kellis, Manolis
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
Nature
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet