Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-188444" >
Rigid template regi...
Rigid template registration in MET images using CUDA
-
- Svensson, Lennart, 1980- (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Uppsala universitet,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Avdelningen för visuell information och interaktion,Centrum för bildanalys,Centre for Image Analysis
-
- Nysjö, Johan (författare)
- Uppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Centrum för bildanalys
-
- Brun, Anders (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Uppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Centrum för bildanalys,Centre for Image Analysis
-
visa fler...
-
- Nyström, Ingela (författare)
- Uppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Centrum för bildanalys,Uppsala University
-
- Sintorn, Ingela (författare)
- Uppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Centrum för bildanalys
-
- Sintorn, Ida-Maria (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Centrum för bildanalys,Centre for Image Analysis
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
-
- ISBN 9789898565037
- Rome : SciTePress, 2012
- 2012
- Engelska.
-
Ingår i: VISAPP 2012. - Rome : SciTePress. - 9789898565037 ; 2, s. 418-422
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://res.slu.se/i...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Rigid registration is a basic tool in many applications, especially in Molecular Electron Tomography (MET), and also in, e.g., registration of rigid implants in medical images and as initialization for deformable registration. As MET volumes have a low signal to noise ratio, a complete search of the six-dimensional (6D) parameter space is often employed. In this paper, we describe how rigid registration with normalized cross-correlation can be implemented on the GPU using NVIDIA's parallel computing architecture CUDA. We compare the performance to the Colores software and two Matlab implementations, one of which is using the GPU accelerated JACKET library. With well-aligned padding and using CUDA, the performance increases by an order of a magnitude, making it feasible to work with three-dimensional fitness landscapes, here denoted scoring volumes, that are generated on the fly. This will eventually enable the biologists to interactively register macromolecule chains in MET volumes piece by piece.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Annan data- och informationsvetenskap (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Other Computer and Information Science (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Datorseende och robotik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Computer Vision and Robotics (hsv//eng)
Nyckelord
- three-dimensional rigid registration
- normalized cross correlation
- molecular electron tomography
- CUDA
- Datoriserad bildanalys
- Computerized Image Analysis
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- kon (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas