Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-25430" >
Influences on gene ...
-
Jin, HainingStockholms universitet,Institutionen för genetik, mikrobiologi och toxikologi
(författare)
Influences on gene expression in vivo by a Shine-Dalgarno sequence.
- Artikel/kapitelEngelska2006
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
Wiley,2006
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-25430
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-25430URI
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-25908URI
-
https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.2006.05110.xDOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:vet swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
The Shine-Dalgarno (SD+: 5'-AAGGAGG-3') sequence anchors the mRNA by basepairing to the 16S rRNA in the small ribosomal subunit during translation initiation. We have here comparedhow an SD+ sequence influences gene expression, if located upstream or downstream of an initiation codon.The positive effect of an upstream SD+ is confirmed. A downstream SD+ gives decreased gene expression.This effect is also valid for appropriately modified natural Escherichia coli genes. If an SD+ is placedbetween two potential initiation codons, initiation takes place predominantly at the second start site.The first start site is activated if the distance between this site and the downstream SD+ is enlargedand/or if the second start site is weakened. Upstream initiation is eliminated if a stable stem-loopstructure is placed between this SD+ and the upstream start site. The results suggest that the two startsites compete for ribosomes that bind to an SD+ located between them. A minor positive contribution toupstream initiation resulting from 3' to 5' ribosomal diffusion along the mRNA is suggested. Analysisof the E. coli K12 genome suggests that the SD+ or SD-like sequences are systematically avoided in theearly coding region suggesting an evolutionary significance.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Zhao, QingStockholms universitet,Institutionen för genetik, mikrobiologi och toxikologi
(författare)
-
Gonzalez de Valdivia, Ernesto IStockholms universitet,Institutionen för genetik, mikrobiologi och toxikologi
(författare)
-
Ardell, David HUppsala universitet,Centrum för bioinformatik,Ardell
(författare)
-
Stenström, MagnusStockholms universitet,Institutionen för genetik, mikrobiologi och toxikologi
(författare)
-
Isaksson, Leif AStockholms universitet,Institutionen för genetik, mikrobiologi och toxikologi
(författare)
-
Stockholms universitetInstitutionen för genetik, mikrobiologi och toxikologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Mol Microbiol: Wiley60:2, s. 480-920950-382X1365-2958
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas