SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-311791"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-311791" > Cancer specific cha...

  • Qu, YingKarolinska Institutet (författare)

Cancer specific changes in DNA methylation reveal aberrant silencing and activation of enhancers in leukemia

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • American Society of Hematology,2017
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-311791
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-311791URI
  • https://doi.org/10.1182/blood-2016-07-726877DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:135391498URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Acute myeloid leukemia (AML) is characterized by an impaired differentiation process leading to an accumulation of immature blasts in the blood. One feature of cytogenetically normal AML is alterations to the DNA methylome. Here we have analyzed 57 AML patients with normal karyotype using Illuminas 450 k array and show that aberrant DNA methylation is significantly altered at enhancer regions and that the methylation levels at specific enhancers predict overall survival of AML patients. The majority of sites that become differentially methylated in AML occur in regulatory elements of the human genome. Hypermethylation associates with enhancer silencing. In addition, ChIP-seq analyses showed that a subset of hypomethylated sites correlate with enhancer activation, indicated by increased H3K27 acetylation. DNA hypomethylation is not therefore sufficient for enhancer activation. Some sites of hypomethylation occur at weak / poised enhancers marked with H3K4 monomethylation in hematopoietic progenitor cells. Other hypomethylated regions occur at sites inactive in progenitors and reflect the de novo acquisition of AML specific enhancers. Altered enhancer dynamics are reflected in the gene expression of enhancer target genes including genes involved in oncogenesis and blood cell development. This study demonstrates that histone variants and different histone modifications interact with aberrant DNA methylation, causing perturbed enhancer activity in CN-AML that contributes to a leukemic transcriptome.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Siggens, LeeKarolinska Institutet (författare)
  • Cordeddu, LinaKarolinska Inst, Dept Biosci & Nutr, Stockholm, Sweden (författare)
  • Gaidzik, Verena IUniv Hosp Ulm, Dept Internal Med 3, Ulm, Germany (författare)
  • Karlsson, KasperKarolinska Institutet (författare)
  • Bullinger, LarsUniv Hosp Ulm, Dept Internal Med 3, Ulm, Germany (författare)
  • Döhner, KonstanzeUniv Hosp Ulm, Dept Internal Med 3, Ulm, Germany (författare)
  • Ekwall, KarlKarolinska Inst, Dept Biosci & Nutr, Stockholm, Sweden (författare)
  • Lehmann, SörenKarolinska Institutet,Uppsala universitet,Hematologi,Ctr Hematol & Regenerat Med, Dept Med Huddinge, Huddinge, Sweden; Karolinska Univ Hosp, Hematol Ctr, Stockholm, Sweden(Swepub:uu)sorle534 (författare)
  • Lennartsson, AndreasKarolinska Institutet (författare)
  • Karolinska InstitutetKarolinska Inst, Dept Biosci & Nutr, Stockholm, Sweden (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Blood: American Society of Hematology129:7, s. e13-e250006-49711528-0020

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • Blood (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy