New computerized staging method to analyze mink testicular tissue in environmental research

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-315061" > New computerized st...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Fakhrzadeh, AzadehSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Uppsala universitet,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Centrum för bildanalys,Centre for Image Analysis (författare)

New computerized staging method to analyze mink testicular tissue in environmental research

Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2016-08-12
Wiley,2017
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-315061
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-315061URI
https://doi.org/10.1002/etc.3517DOI
https://res.slu.se/id/publ/90935URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Histopathology of testicular tissue is considered to be the most sensitive tool to detect adverse effects on male reproduction. When assessing tissue damage, seminiferous epithelium needs to be classified into different stages to detect certain cell damages; but stage identification is a demanding task. The authors present a method to identify the 12 stages in mink testicular tissue. The staging system uses Gata-4 immunohistochemistry to visualize acrosome development and proved to be both intraobserver-reproducible and interobserver-reproducible with a substantial agreement of 83.6% (kappa=0.81) and 70.5% (kappa=0.67), respectively. To further advance and objectify this method, they present a computerized staging system that identifies these 12 stages. This program has an agreement of 52.8% (kappa 0.47) with the consensus staging by 2 investigators. The authors propose a pooling of the stages into 5 groups based on morphology, stage transition, and toxicologically important endpoints. The computerized program then reached a substantial agreement of 76.7% (kappa=0.69). The computerized staging tool uses local ternary patterns to describe the texture of the tubules and a support vector machine classifier to learn which textures correspond to which stages. The results have the potential to modernize the tedious staging process required in toxicological evaluation of testicular tissue, especially if combined with whole-slide imaging and automated tubular segmentation. Environ Toxicol Chem 2017;36:156-164.

Ämnesord och genrebeteckningar

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER Medicinteknik Medicinsk bildbehandling hsv//swe
ENGINEERING AND TECHNOLOGY Medical Engineering Medical Image Processing hsv//eng
NATURVETENSKAP Data- och informationsvetenskap Datavetenskap hsv//swe
NATURAL SCIENCES Computer and Information Sciences Computer Sciences hsv//eng
LANTBRUKSVETENSKAPER Veterinärmedicin Patobiologi hsv//swe
AGRICULTURAL SCIENCES Veterinary Science Pathobiology hsv//eng
NATURVETENSKAP Geovetenskap och miljövetenskap Miljövetenskap hsv//swe
NATURAL SCIENCES Earth and Related Environmental Sciences Environmental Sciences hsv//eng
Male reproductive toxicology
Endocrine disruptor
Computational toxicology
Histopathology
Method

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Spörndly-Nees, EllinorSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för anatomi, fysiologi och biokemi,Department of Anatomy, Physiology and Biochemistry (AFB)(Swepub:slu)49486 (författare)
Ekstedt, ElisabethSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för anatomi, fysiologi och biokemi,Department of Anatomy, Physiology and Biochemistry (AFB)(Swepub:slu)46786 (författare)
Holm, LenaSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för anatomi, fysiologi och biokemi,Department of Anatomy, Physiology and Biochemistry (AFB)(Swepub:slu)48426 (författare)
Luengo Hendriks, Cris L.Uppsala universitet,Bildanalys och människa-datorinteraktion,U(Swepub:uu)crilu684 (författare)
Uppsala universitetBildanalys och människa-datorinteraktion (creator_code:org_t)
Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

Ingår i:Environmental Toxicology and Chemistry: Wiley36:1, s. 156-1640730-72681552-8618

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Environmental Toxicology and Chemistry (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Fakhrzadeh, Azad ...; Spörndly-Nees, E ...; Ekstedt, Elisabe ...; Holm, Lena; Luengo Hendriks, ...

Om ämnet

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER: TEKNIK OCH TEKNO ...; och Medicinteknik; och Medicinsk bildbe ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Data och informa ...; och Datavetenskap

LANTBRUKSVETENSKAPER: LANTBRUKSVETENSK ...; och Veterinärmedicin; och Patobiologi

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Geovetenskap och ...; och Miljövetenskap

Artiklar i publikationen: Environmental To ...

Av lärosätet: Uppsala universitet; Sveriges Lantbruksuniversitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se