Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-331956" >
PepBio :
PepBio : predicting the bioactivity of host defense peptides
-
- Simeon, Saw (författare)
- Mahidol Univ, Ctr Data Min & Biomed Informat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.;Kasetsart Univ, Fac Sci, Interdisciplinary Grad Program Biosci, Bangkok 10900, Thailand.
-
- Li, Hao (författare)
- Mahidol Univ, Ctr Data Min & Biomed Informat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.
-
- Win, Thet Su (författare)
- Mahidol Univ, Ctr Data Min & Biomed Informat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.
-
visa fler...
-
- Malik, Aijaz Ahmad (författare)
- Mahidol Univ, Ctr Data Min & Biomed Informat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.
-
- Kandhro, Abdul Hafeez (författare)
- Mahidol Univ, Ctr Data Min & Biomed Informat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.;Mahidol Univ, Ctr Res & Innovat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.
-
- Piacham, Theeraphon (författare)
- Mahidol Univ, Dept Clin Microbiol & Appl Technol, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.
-
- Shoombuatong, Watshara (författare)
- Mahidol Univ, Ctr Data Min & Biomed Informat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.
-
- Nuchnoi, Pornlada (författare)
- Mahidol Univ, Ctr Res & Innovat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.
-
- Wikberg, Jarl E. S. (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap
-
- Gleeson, M. Paul (författare)
- King Mongkuts Inst Technol Ladkrabang, Dept Biomed Engn, Fac Engn, Bangkok 10520, Thailand.
-
- Nantasenamat, Chanin (författare)
- Mahidol Univ, Ctr Data Min & Biomed Informat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand.
-
visa färre...
-
Mahidol Univ, Ctr Data Min & Biomed Informat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand;Kasetsart Univ, Fac Sci, Interdisciplinary Grad Program Biosci, Bangkok 10900, Thailand. Mahidol Univ, Ctr Data Min & Biomed Informat, Fac Med Technol, Bangkok 10700, Thailand. (creator_code:org_t)
- 2017
- 2017
- Engelska.
-
Ingår i: RSC Advances. - : Royal Society of Chemistry (RSC). - 2046-2069. ; 7:56, s. 35119-35134
- Relaterad länk:
-
https://pubs.rsc.org...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Host defense peptides (HDPs) represents a class of ubiquitous and rapid responding immune molecules capable of direct inactivation of a wide range of pathogens. Recent research has shown HDPs to be promising candidates for development as a novel class of broad-spectrum chemotherapeutic agent that is effective against both pathogenic microbes and malignant neoplasm. This study aims to quantitatively explore the relationship between easy-to-interpret amino acid composition descriptors of HDPs with their respective bioactivities. Classification models were constructed using the C4.5 decision tree and random forest classifiers. Good predictive performance was achieved as deduced from the accuracy, sensitivity and specificity in excess of 90% and Matthews correlation coefficient in excess of 0.5 for all three evaluated data subsets (e.g. training, 10-fold cross-validation and external validation sets). The source code and data set used for the construction of classification models are available on GitHub at https://github.com/chaninn/pepbio/.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Farmaceutiska vetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Pharmaceutical Sciences (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Simeon, Saw
-
Li, Hao
-
Win, Thet Su
-
Malik, Aijaz Ahm ...
-
Kandhro, Abdul H ...
-
Piacham, Theerap ...
-
visa fler...
-
Shoombuatong, Wa ...
-
Nuchnoi, Pornlad ...
-
Wikberg, Jarl E. ...
-
Gleeson, M. Paul
-
Nantasenamat, Ch ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Farmaceutiska ve ...
- Artiklar i publikationen
-
RSC Advances
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet