Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-366980" >
Ten steps to get st...
Ten steps to get started in Genome Assembly and Annotation.
-
Dominguez Del Angel, Victoria (författare)
-
Hjerde, Erik (författare)
-
Sterck, Lieven (författare)
-
visa fler...
-
Capella-Gutierrez, Salvadors (författare)
-
Notredame, Cederic (författare)
-
- Vinnere, Olga (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
Amselem, Joelle (författare)
-
Bouri, Laurent (författare)
-
Bocs, Stephanie (författare)
-
Klopp, Christophe (författare)
-
Gibrat, Jean-Francois (författare)
-
Vlasova, Anna (författare)
-
Leskosek, Brane L (författare)
-
- Soler, Lucile (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
- Binzer-Panchal, Mahesh (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
- Lantz, Henrik (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2018-02-05
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: F1000Research. - : F1000 Research Ltd. - 2046-1402. ; 7
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://f1000researc...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- As a part of the ELIXIR-EXCELERATE efforts in capacity building, we present here 10 steps to facilitate researchers getting started in genome assembly and genome annotation. The guidelines given are broadly applicable, intended to be stable over time, and cover all aspects from start to finish of a general assembly and annotation project. Intrinsic properties of genomes are discussed, as is the importance of using high quality DNA. Different sequencing technologies and generally applicable workflows for genome assembly are also detailed. We cover structural and functional annotation and encourage readers to also annotate transposable elements, something that is often omitted from annotation workflows. The importance of data management is stressed, and we give advice on where to submit data and how to make your results Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable (FAIR).
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Annotation
- Assembly
- DNA
- FAIR
- Genome
- NGS
- Workflows
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Dominguez Del An ...
-
Hjerde, Erik
-
Sterck, Lieven
-
Capella-Gutierre ...
-
Notredame, Ceder ...
-
Vinnere, Olga
-
visa fler...
-
Amselem, Joelle
-
Bouri, Laurent
-
Bocs, Stephanie
-
Klopp, Christoph ...
-
Gibrat, Jean-Fra ...
-
Vlasova, Anna
-
Leskosek, Brane ...
-
Soler, Lucile
-
Binzer-Panchal, ...
-
Lantz, Henrik
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
-
F1000Research
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet