SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-380966"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-380966" > Using multitype bra...

Using multitype branching models to analyze bacterial pathogenicity

Tahir, Daniah, 1988- (författare)
Uppsala universitet,Matematiska institutionen
Kaj, Ingemar, 1957- (författare)
Uppsala universitet,Matematiska institutionen
Bartoszek, Krzysztof, 1984- (författare)
Uppsala universitet,Matematiska institutionen
visa fler...
Majchrzak, Marta (författare)
Institute of Medical Biology, Polish Academy of Sciences, Poland
Parniewski, Pawel (författare)
Institute of Medical Biology, Polish Academy of Sciences, Poland
Sakowski, Sebastian (författare)
Faculty of Mathematics and Computer Science, University of Lodz, Poland
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Engelska.
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • We apply multitype, continuous time Markov branching models to study pathogenicity in E. coli, a bacterium belonging to the genus Escherichia. First, we examine briefly the properties of multitype branching processes and we also survey some fundamental limit theorems regarding the behavior of such models under various conditions. These theorems are then applied to discrete, state dependent models in order to analyze pathogenicity in a published clinical data set consisting of 251 strains of E. coli. We use well established methods, incorporating maximum likelihood techniques, to estimate speciation rates as well as the rates of transition between different states of the models. From the analysis, we not only derive new results, we also verify some preexisting notions about virulent behavior in bacterial strains.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Matematik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Mathematics (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Nyckelord

Markov models
branching processes
limit theorems
virulence factors
E. coli strains.

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy