Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-396656" >
A clonal expression...
A clonal expression biomarker associates with lung cancer mortality
-
- Biswas, Dhruva (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England;UCL, Inst Canc, Bill Lyons Informat Ctr, Paul OGorman Bldg, London, England;Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England,University College London,Francis Crick Institute
-
- Birkbak, Nicolai J. (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England;Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England;Aarhus Univ, Dept Mol Med, Aarhus, Denmark;Aarhus Univ, Bioinformat Res Ctr, Aarhus, Denmark,Francis Crick Institute,University College London,Aarhus University
-
- Rosenthal, Rachel (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England;UCL, Inst Canc, Bill Lyons Informat Ctr, Paul OGorman Bldg, London, England;Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England,University College London,Francis Crick Institute
-
visa fler...
-
- Hiley, Crispin T. (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England;Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England,Francis Crick Institute,University College London
-
- Lim, Emilia L. (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England;Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England,Francis Crick Institute,University College London
-
- Papp, Krisztian (författare)
- Eotvos Lorand Univ, Dept Phys Complex Syst, Budapest, Hungary,Eötvös Loránd University
-
- Boeing, Stefan (författare)
- Francis Crick Inst, Bioinformat & Biostat, London, England,Francis Crick Institute
-
- Krzystanek, Marcin (författare)
- Danish Canc Soc, Res Ctr, Copenhagen, Denmark,Danish Cancer Society
-
- Djureinovic, Dijana (författare)
- Uppsala University,Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi
-
- La Fleur, Linnea (författare)
- Uppsala University,Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Johan Botling
-
- Greco, Maria (författare)
- Francis Crick Inst, Genom Equipment Pk, London, England,Francis Crick Institute
-
- Döme, Balázs (författare)
- Semmelweis Univ, Natl Koranyi Inst Pulmonol, Dept Tumor Biol, Budapest, Hungary;Med Univ Vienna, Ctr Comprehens Canc, Div Thorac Surg, Vienna, Austria;Semmelweis Univ, Natl Inst Oncol, Dept Thorac Surg, Budapest, Hungary,Medical University of Vienna,Semmelweis University
-
- Fillinger, Janos (författare)
- Semmelweis Univ, Natl Koranyi Inst Pulmonol, Dept Pathol, Budapest, Hungary;Natl Inst Oncol, Dept Pathol, Budapest, Hungary,National Institute of Oncology, Budapest,Semmelweis University
-
- Brunnström, Hans (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Förbättrad diagnostik och prognostik vid lungcancer och metastaser till lunga,Forskargrupper vid Lunds universitet,Improved diagnostics and prognostics of lung cancer and metastases to the lungs,Lund University Research Groups,Region Skåne,Lund Univ, Lab Med Reg Skane, Dept Clin Sci Lund, Pathol, Lund, Sweden
-
- Wu, Yin (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England,University College London
-
- Moore, David A. (författare)
- UCL Canc Inst, Dept Pathol, London, England,UCL Cancer Institute
-
- Skrzypski, Marcin (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England;Med Univ Gdansk, Dept Oncol & Radiotherapy, Gdansk, Poland,University College London,Medical University of Gdansk
-
- Abbosh, Christopher (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England,University College London
-
- Litchfield, Kevin (författare)
- Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England,Francis Crick Institute
-
- Al Bakir, Maise (författare)
- Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England,Francis Crick Institute
-
- Watkins, Thomas B. K. (författare)
- Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England,Francis Crick Institute
-
- Veeriah, Selvaraju (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England,University College London
-
- Wilson, Gareth A. (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England;Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England,University College London,Francis Crick Institute
-
- Jamal-Hanjani, Mariam (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England,University College London
-
- Moldvay, Judit (författare)
- Semmelweis Univ, Natl Koranyi Inst Pulmonol, Dept Tumor Biol, Budapest, Hungary;Semmelweis Univ, Dept Pathol 2, SE NAP Brain Metastasis Res Grp, Budapest, Hungary,Semmelweis University
-
- Botling, Johan (författare)
- Uppsala University,Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Johan Botling
-
- Chinnaiyan, Arul M. (författare)
- Univ Michigan, Michigan Ctr Translat Pathol, Ann Arbor, MI 48109 USA;Univ Michigan, Dept Pathol, Ann Arbor, MI 48109 USA;Univ Michigan, Rogel Canc Ctr, Ann Arbor, MI 48109 USA;Univ Michigan, Dept Urol, Ann Arbor, MI 48109 USA;Univ Michigan, Howard Hughes Med Inst, Ann Arbor, MI 48109 USA,University of Michigan
-
- Micke, Patrick (författare)
- Uppsala University,Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Patrick Micke
-
- Hackshaw, Allan (författare)
- UCL, Canc Res UK, London, England;UCL, Univ Coll London Canc Trials Ctr, London, England,University College London
-
- Bartek, Jiri (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Danish Cancer Society,Danish Canc Soc, Res Ctr, Copenhagen, Denmark;Karolinska Inst, Dept Med Biochem & Biophys, Stockholm, Sweden
-
- Csabai, Istvan (författare)
- Eotvos Lorand Univ, Dept Phys Complex Syst, Budapest, Hungary,Eötvös Loránd University
-
- Szallasi, Zoltan (författare)
- Danish Canc Soc, Res Ctr, Copenhagen, Denmark;Semmelweis Univ, Dept Pathol 2, SE NAP Brain Metastasis Res Grp, Budapest, Hungary;Harvard Med Sch, Boston Childrens Hosp, Computat Hlth Informat Program, Boston, MA 02115 USA,Harvard University,Semmelweis University,Danish Cancer Society,Boston Children's Hospital
-
- Herrero, Javier (författare)
- UCL, Inst Canc, Bill Lyons Informat Ctr, Paul OGorman Bldg, London, England,University College London
-
- McGranahan, Nicholas (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England;UCL, Univ Coll London Canc Inst, Canc Genome Evolut Res Grp, London, England,University College London
-
- Swanton, Charles (författare)
- UCL, Inst Canc, Canc Res UK Lung Canc Ctr Excellence, Paul OGorman Bldg, London, England;Francis Crick Inst, Canc Evolut & Genome Instabil Lab, London, England,Francis Crick Institute,University College London
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-10-07
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Medicine. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1078-8956 .- 1546-170X. ; 25:10, s. 1540-1548
- Relaterad länk:
-
https://europepmc.or...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- An aim of molecular biomarkers is to stratify patients with cancer into disease subtypes predictive of outcome, improving diagnostic precision beyond clinical descriptors such as tumor stage(1). Transcriptomic intratumor heterogeneity (RNA-ITH) has been shown to confound existing expression-based biomarkers across multiple cancer types(2-6). Here, we analyze multi-region whole-exome and RNA sequencing data for 156 tumor regions from 48 patients enrolled in the TRACERx study to explore and control for RNA-ITH in non-small cell lung cancer. We find that chromosomal instability is a major driver of RNA-ITH, and existing prognostic gene expression signatures are vulnerable to tumor sampling bias. To address this, we identify genes expressed homogeneously within individual tumors that encode expression modules of cancer cell proliferation and are often driven by DNA copy-number gains selected early in tumor evolution. Clonal transcriptomic biomarkers overcome tumor sampling bias, associate with survival independent of clinicopathological risk factors, and may provide a general strategy to refine biomarker design across cancer types.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Klinisk laboratoriemedicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Clinical Laboratory Medicine (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Patologi
- Pathology
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Biswas, Dhruva
-
Birkbak, Nicolai ...
-
Rosenthal, Rache ...
-
Hiley, Crispin T ...
-
Lim, Emilia L.
-
Papp, Krisztian
-
visa fler...
-
Boeing, Stefan
-
Krzystanek, Marc ...
-
Djureinovic, Dij ...
-
La Fleur, Linnea
-
Greco, Maria
-
Döme, Balázs
-
Fillinger, Janos
-
Brunnström, Hans
-
Wu, Yin
-
Moore, David A.
-
Skrzypski, Marci ...
-
Abbosh, Christop ...
-
Litchfield, Kevi ...
-
Al Bakir, Maise
-
Watkins, Thomas ...
-
Veeriah, Selvara ...
-
Wilson, Gareth A ...
-
Jamal-Hanjani, M ...
-
Moldvay, Judit
-
Botling, Johan
-
Chinnaiyan, Arul ...
-
Micke, Patrick
-
Hackshaw, Allan
-
Bartek, Jiri
-
Csabai, Istvan
-
Szallasi, Zoltan
-
Herrero, Javier
-
McGranahan, Nich ...
-
Swanton, Charles
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Klinisk laborato ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Medicine
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Lunds universitet
-
Karolinska Institutet