Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-416854" >
Evolutionary histor...
Evolutionary history of endogenous Human Herpesvirus 6 reflects human migration out of Africa
-
Aswad, Amr (författare)
-
Aimola, Giulia (författare)
-
Wight, Darren (författare)
-
visa fler...
-
Roychoudhury, Pavitra (författare)
-
Zimmermann, Cosima (författare)
-
Hill, Joshua (författare)
-
Lassner, Dirk (författare)
-
Xie, Hong (författare)
-
Huang, Meei-Li (författare)
-
Parrish, Nicholas F (författare)
-
Schultheiss, Heinz-Peter (författare)
-
Venturini, Cristina (författare)
-
- Lager, Susanne (författare)
- Uppsala universitet,Obstetrisk och reproduktiv hälsoforskning
-
Smith, Gordon C S (författare)
-
Charnock-Jones, D Stephen (författare)
-
Breuer, Judith (författare)
-
Greninger, Alexander L (författare)
-
Kaufer, Benedikt B (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2020-07-28
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: Molecular biology and evolution. - : Oxford University Press. - 0737-4038 .- 1537-1719. ; 38:1, s. 96-107
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://academic.oup...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Human herpesvirus 6A and 6B (HHV-6) can integrate into the germline, and as a result about 70 million people harbour the genome of one of these viruses in every cell of their body. Until now, it has been largely unknown if i) these integrations are ancient, ii) if they still occur, and iii) whether circulating virus strains differ from integrated ones. Here we used next generation sequencing and mining of public human genome datasets to generate the largest and most diverse collection of circulating and integrated HHV-6 genomes studied to date. In genomes of geographically dispersed, only distantly-related people, we identified clades of integrated viruses that originated from a single ancestral event, confirming this with fluorescent in situ hybridization to directly observe the integration locus. In contrast to HHV-6B, circulating and integrated HHV-6A sequences form distinct clades, arguing against ongoing integration of circulating HHV-6A or "reactivation" of integrated HHV-6A. Taken together, our study provides the first comprehensive picture of the evolution of HHV-6, and reveals that integration of heritable HHV-6 has occurred since the time of, if not before, human migrations out of Africa.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- human herpesvirus 6
- phylogenetics
- genomics
- paleovirology
- telomere biology
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Aswad, Amr
-
Aimola, Giulia
-
Wight, Darren
-
Roychoudhury, Pa ...
-
Zimmermann, Cosi ...
-
Hill, Joshua
-
visa fler...
-
Lassner, Dirk
-
Xie, Hong
-
Huang, Meei-Li
-
Parrish, Nichola ...
-
Schultheiss, Hei ...
-
Venturini, Crist ...
-
Lager, Susanne
-
Smith, Gordon C ...
-
Charnock-Jones, ...
-
Breuer, Judith
-
Greninger, Alexa ...
-
Kaufer, Benedikt ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Evolutionsbiolog ...
- Artiklar i publikationen
-
Molecular biolog ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet