SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-455805"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-455805" > Single-cell RNA seq...

  • He, BingKarolinska Institutet (författare)

Single-cell RNA sequencing reveals the mesangial identity and species diversity of glomerular cell transcriptomes

  • Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2021-04-09
  • Springer Nature,2021
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-455805
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-455805URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-021-22331-9DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:147325878URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Molecular characterization of the individual cell types in human kidney as well as model organisms are critical in defining organ function and understanding translational aspects of biomedical research. Previous studies have uncovered gene expression profiles of several kidney glomerular cell types, however, important cells, including mesangial (MCs) and glomerular parietal epithelial cells (PECs), are missing or incompletely described, and a systematic comparison between mouse and human kidney is lacking. To this end, we use Smart-seq2 to profile 4332 individual glomerulus-associated cells isolated from human living donor renal biopsies and mouse kidney. The analysis reveals genetic programs for all four glomerular cell types (podocytes, glomerular endothelial cells, MCs and PECs) as well as rare glomerulus-associated macula densa cells. Importantly, we detect heterogeneity in glomerulus-associated Pdgfrb-expressing cells, including bona fide intraglomerular MCs with the functionally active phagocytic molecular machinery, as well as a unique mural cell type located in the central stalk region of the glomerulus tuft. Furthermore, we observe remarkable species differences in the individual gene expression profiles of defined glomerular cell types that highlight translational challenges in the field and provide a guide to design translational studies. The molecular identity of renal glomerular cells is poorly characterized and rodent glomerulopathy models translate poorly to humans. Here, the authors show molecular signatures of glomerulus-associated cells using single cell RNA sequencing and highlight differences between mouse and human cells.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Chen, PingKarolinska Institutet (författare)
  • Zambrano, SoniaKarolinska Institutet (författare)
  • Dabaghie, DinaKarolinska Institutet (författare)
  • Hu, YizhouKarolinska Institutet (författare)
  • Möller-Hackbarth, KatjaAstraZeneca Integrated Cardio Metab Ctr ICMC, Karolinska Inst, Huddinge, Sweden. (författare)
  • Unnersjö-Jess, DavidUniv Cologne, Dept Internal Med 2, Cologne, Germany.;Univ Cologne, Ctr Mol Med Cologne CMMC, Cologne, Germany.;Univ Cologne, Cologne Excellence Cluster Cellular Stress Respon, Cologne, Germany. (författare)
  • Korkut, Gül GizemAstraZeneca Integrated Cardio Metab Ctr ICMC, Karolinska Inst, Huddinge, Sweden. (författare)
  • Charrin, EmmanuelleKarolinska Institutet (författare)
  • Jeansson, MarieKarolinska Institutet (författare)
  • Bintanel-Morcillo, MariaAstraZeneca Integrated Cardio Metab Ctr ICMC, Karolinska Inst, Huddinge, Sweden.;Karolinska Univ, Dept Lab Med, Div Pathol, Hosp Huddinge, Huddinge, Sweden. (författare)
  • Witasp, AnnaKarolinska Institutet (författare)
  • Wennberg, LarsKarolinska Inst, Dept Clin Sci Intervent & Technol, Div Transplantat, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Wernerson, AnnikaKarolinska Institutet (författare)
  • Schermer, BernhardUniv Cologne, Dept Internal Med 2, Cologne, Germany.;Univ Cologne, Ctr Mol Med Cologne CMMC, Cologne, Germany.;Univ Cologne, Cologne Excellence Cluster Cellular Stress Respon, Cologne, Germany. (författare)
  • Benzing, ThomasUniv Cologne, Dept Internal Med 2, Cologne, Germany.;Univ Cologne, Ctr Mol Med Cologne CMMC, Cologne, Germany.;Univ Cologne, Cologne Excellence Cluster Cellular Stress Respon, Cologne, Germany. (författare)
  • Ernfors, PatrikKarolinska Institutet (författare)
  • Betsholtz, ChristerUppsala universitet,Vaskulärbiologi,AstraZeneca Integrated Cardio Metab Ctr ICMC, Karolinska Inst, Huddinge, Sweden.(Swepub:uu)chbet517 (författare)
  • Lal, MarkAstraZeneca, R&D Biopharmaceut, Biosci Cardiovasc Renal & Metab, Gothenburg, Sweden. (författare)
  • Sandberg, RickardKarolinska Institutet (författare)
  • Patrakka, JaakkoKarolinska Institutet (författare)
  • Karolinska InstitutetAstraZeneca Integrated Cardio Metab Ctr ICMC, Karolinska Inst, Huddinge, Sweden. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: Springer Nature12:12041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy