SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-469951"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-469951" > Automated detection...

Automated detection of vascular remodeling in human tumor draining lymph nodes by the deep learning tool HEV-finder

Bekkhus, Tove (författare)
Uppsala universitet,Vaskulärbiologi
Avenel, Christophe (författare)
Uppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion
Hanna, Sabella (författare)
Uppsala universitet,Vaskulärbiologi
visa fler...
Franzén Boger, Mathias (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
Klemm, Anna H (författare)
Uppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Vasiliu-Bacovia, Daniel (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
Wärnberg, Fredrik (författare)
Department of Surgery, Institute of Clinical Sciences, Sahlgrenska Academy at the University of Gothenburg, Gothenburg, Sweden
Wählby, Carolina, professor, 1974- (författare)
Uppsala universitet,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Avdelningen för visuell information och interaktion
Ulvmar, Maria H. (författare)
Uppsala universitet,Vaskulärbiologi
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2022-07-12
2022
Engelska.
Ingår i: Journal of Pathology. - : John Wiley & Sons. - 0022-3417 .- 1096-9896. ; 258:1, s. 4-11
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Vascular remodeling is common in human cancer and has potential as future biomarkers for prediction of disease progression and tumor immunity status. It can also affect metastatic sites, including the tumor-draining lymph nodes (TDLNs). Dilation of the high endothelial venules (HEVs) within TDLNs has been observed in several types of cancer. We recently demonstrated that it is a premetastatic effect that can be linked to tumor invasiveness in breast cancer. Manual visual assessment of changes in vascular morphology is a tedious and difficult task, limiting high-throughput analysis. Here we present a fully automated approach for detection and classification of HEV dilation. By using 12,524 manually classified HEVs, we trained a deep-learning model and created a graphical user interface for visualization of the results. The tool, named the HEV-finder, selectively analyses HEV dilation in specific regions of the lymph nodes. We evaluated the HEV-finder's ability to detect and classify HEV dilation in different types of breast cancer compared to manual annotations. Our results constitute a successful example of large-scale, fully automated, and user-independent, image-based quantitative assessment of vascular remodeling in human pathology and lay the ground for future exploration of HEV dilation in TDLNs as a biomarker.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)

Nyckelord

HEV-finder
artificial intelligence (AI)
breast cancer
deep learning
high endothelial venules (HEVs)
tumor-draining lymph nodes (TDLNs)
vascular remodeling

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy