Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-480377" >
Endothelial cell he...
-
Wang, FeiBGI Shenzhen, BGI Qingdao, Qingdao Europe Adv Inst Life Sci, Lars Bolund Inst Regenerat Med, Qingdao, Peoples R China.;Aarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.
(författare)
Endothelial cell heterogeneity and microglia regulons revealed by a pig cell landscape at single-cell level
- Artikel/kapitelEngelska2022
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2022-06-24
-
Springer Nature,2022
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-480377
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-480377URI
-
https://doi.org/10.1038/s41467-022-31388-zDOI
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-315532URI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:150079864URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Correction in: Nature communications Vol 13 (2022), article number 6748.DOI: 10.1038/s41467-022-34498-w
-
Correction in: Nature Communications, vol. 13, issue. 1. DOI: 10.1038/s41467-022-34498-w, WOS: 000885370100016, ScopusID: 2-s2.0-85141346712QC 20220707
-
Pigs are valuable large animal models for biomedical and genetic research, but insights into the tissue- and cell-type-specific transcriptome and heterogeneity remain limited. By leveraging single-cell RNA sequencing, we generate a multiple-organ single-cell transcriptomic map containing over 200,000 pig cells from 20 tissues/organs. We comprehensively characterize the heterogeneity of cells in tissues and identify 234 cell clusters, representing 58 major cell types. In-depth integrative analysis of endothelial cells reveals a high degree of heterogeneity. We identify several functionally distinct endothelial cell phenotypes, including an endothelial to mesenchymal transition subtype in adipose tissues. Intercellular communication analysis predicts tissue- and cell type-specific crosstalk between endothelial cells and other cell types through the VEGF, PDGF, TGF-beta, and BMP pathways. Regulon analysis of single-cell transcriptome of microglia in pig and 12 other species further identifies MEF2C as an evolutionally conserved regulon in the microglia. Our work describes the landscape of single-cell transcriptomes within diverse pig organs and identifies the heterogeneity of endothelial cells and evolutionally conserved regulon in microglia.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Ding, PeiwenBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China.
(författare)
-
Liang, XueUniv Copenhagen, Dept Biol, Copenhagen, Denmark.
(författare)
-
Ding, XiangningBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China.
(författare)
-
Brandt, Camilla BlunkAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;Aarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark.
(författare)
-
Sjostedt, EvelinaKarolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
(författare)
-
Zhu, JiachengBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China.
(författare)
-
Bolund, SagaKarolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
(författare)
-
Zhang, LijingBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;BGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China.
(författare)
-
de Rooij, Laura P. M. H.VIB, Ctr Canc Biol, Lab Angiogenesis & Vasc Metab, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Leuven Canc Inst, Dept Oncol, Leuven, Belgium.,BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China.
(författare)
-
Luo, LihuaBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China.
(författare)
-
Wei, YananBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China.
(författare)
-
Zhao, WandongBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China.
(författare)
-
Lv, ZhiyuanBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China.
(författare)
-
Hasko, JanosAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.
(författare)
-
Li, RunchuBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China.
(författare)
-
Qin, QiuyuBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China.
(författare)
-
Jia, YiBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China.
(författare)
-
Wu, WendiBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China.
(författare)
-
Yuan, YutingBinzhou Med Univ, Sch Basic Med Sci, Yantai, Peoples R China.
(författare)
-
Pu, MingyiBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China.
(författare)
-
Wang, HaoyuBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China.
(författare)
-
Wu, AipingChinese Acad Med Sci, Peking Union Med Coll, Inst Syst Med, Beijing, Peoples R China.;Suzhou Inst Syst Med, Suzhou, Peoples R China.
(författare)
-
Xie, LinBGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China.
(författare)
-
Liu, PingBGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China.
(författare)
-
Chen, FangBGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China.
(författare)
-
Herold, JacquelineAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.
(författare)
-
Kalucka, JoannaAarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark.;Aarhus Univ, Aarhus Univ Adv Studies AIAS, Aarhus, Denmark.
(författare)
-
Karlsson, MaxKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Proteinvetenskap,KTH Royal Inst Technol, Sci Life Lab, Dept Prot Sci, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1hm1ssx
(författare)
-
Zhang, XiuqingBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China.
(författare)
-
Helmig, Rikke BekAarhus Univ Hosp, Dept Obstet & Gynecol, Aarhus, Denmark.
(författare)
-
Fagerberg, LinnKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Proteinvetenskap,KTH Royal Inst Technol, Sci Life Lab, Dept Prot Sci, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1dglfid
(författare)
-
Lindskog, CeciliaUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)cecli129
(författare)
-
Pontén, FredrikUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)fredpont
(författare)
-
Uhlén, MathiasKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Proteinvetenskap,Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.;KTH Royal Inst Technol, Sci Life Lab, Dept Prot Sci, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1dulvmw
(författare)
-
Bolund, LarsBGI Shenzhen, BGI Qingdao, Qingdao Europe Adv Inst Life Sci, Lars Bolund Inst Regenerat Med, Qingdao, Peoples R China.;Aarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.
(författare)
-
Jessen, NielsAarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark.
(författare)
-
Jiang, HuiBGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China.
(författare)
-
Xu, XunBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.
(författare)
-
Yang, HuanmingBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Chinese Acad Sci, Univ Chinese Acad Sci, Inst Basic Med & Canc IBMC, IBMC BGI Ctr,Canc Hosp,Zhejiang Canc Hosp, Hangzhou, Peoples R China.
(författare)
-
Carmeliet, PeterAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;VIB, Ctr Canc Biol, Lab Angiogenesis & Vasc Metab, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Leuven Canc Inst, Dept Oncol, Leuven, Belgium.;Khalifa Univ Sci & Technol, Ctr Biotechnol, Abu Dhabi, U Arab Emirates.
(författare)
-
Mulder, JanKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
(författare)
-
Chen, DongshengBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Suzhou Inst Syst Med, Suzhou, Peoples R China.
(författare)
-
Lin, LinAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;Aarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark.
(författare)
-
Luo, YonglunBGI Shenzhen, BGI Qingdao, Qingdao Europe Adv Inst Life Sci, Lars Bolund Inst Regenerat Med, Qingdao, Peoples R China.;Aarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Aarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark.
(författare)
-
BGI Shenzhen, BGI Qingdao, Qingdao Europe Adv Inst Life Sci, Lars Bolund Inst Regenerat Med, Qingdao, Peoples R China.;Aarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China.
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Communications: Springer Nature13:12041-1723
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Wang, Fei
-
Ding, Peiwen
-
Liang, Xue
-
Ding, Xiangning
-
Brandt, Camilla ...
-
Sjostedt, Evelin ...
-
visa fler...
-
Zhu, Jiacheng
-
Bolund, Saga
-
Zhang, Lijing
-
de Rooij, Laura ...
-
Luo, Lihua
-
Wei, Yanan
-
Zhao, Wandong
-
Lv, Zhiyuan
-
Hasko, Janos
-
Li, Runchu
-
Qin, Qiuyu
-
Jia, Yi
-
Wu, Wendi
-
Yuan, Yuting
-
Pu, Mingyi
-
Wang, Haoyu
-
Wu, Aiping
-
Xie, Lin
-
Liu, Ping
-
Chen, Fang
-
Herold, Jacqueli ...
-
Kalucka, Joanna
-
Karlsson, Max
-
Zhang, Xiuqing
-
Helmig, Rikke Be ...
-
Fagerberg, Linn
-
Lindskog, Cecili ...
-
Pontén, Fredrik
-
Uhlén, Mathias
-
Bolund, Lars
-
Jessen, Niels
-
Jiang, Hui
-
Xu, Xun
-
Yang, Huanming
-
Carmeliet, Peter
-
Mulder, Jan
-
Chen, Dongsheng
-
Lin, Lin
-
Luo, Yonglun
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Cellbiologi
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Karolinska Institutet