Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-524607" >
Sensitive and Speci...
Sensitive and Specific Analyses of Colorectal Cancer Recurrence through Multiplex superRCA Mutation Detection in Blood Plasma
-
- Sandberg, Emma (författare)
- Uppsala universitet,Cancerprecisionsmedicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Tobias Sjöblom
-
- Nunes, Luís, 1995- (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cancerprecisionsmedicin,Tobias Sjöblom
-
- Edqvist, Per-Henrik (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cancerprecisionsmedicin,Tobias Sjöblom
-
visa fler...
-
- Mathot, Lucy (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cancerprecisionsmedicin,Panagiotis Baliakas
-
- Chen, Lei, 1985- (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylära verktyg och funktionsgenomik,Rarity Biosci AB, SE-75237 Uppsala, Sweden,Ulf Landegren
-
- Edgren, Tomas (författare)
- Rarity Biosci AB, SE-75237 Uppsala, Sweden.
-
- Al Nassralla, Shahed (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Glimelius, Bengt (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cancerprecisionsmedicin,Bengt Glimelius
-
- Landegren, Ulf (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylära verktyg och funktionsgenomik,Ulf Landegren
-
- Sjöblom, Tobias (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cancerprecisionsmedicin,Tobias Sjöblom
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- MDPI, 2024
- 2024
- Engelska.
-
Ingår i: Cancers. - : MDPI. - 2072-6694. ; 16:3
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.3...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.3...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Mutation analysis of circulating tumor DNA (ctDNA) has applications in monitoring of colorectal cancer (CRC) patients for recurrence. Considering the low tumor fraction of ctDNA in cell-free DNA (cfDNA) isolated from blood plasma, the sensitivity of the detection method is important. Here, plasma DNA collected at diagnosis and follow-up from 25 CRC patients was analyzed using a multiplex superRCA mutation detection assay. The assay was also performed on genomic DNA (gDNA) from tumor and normal tissue from 20 of these patients. The lower limit of detection for most sequence variants was in the range of 10−5, while when analyzing cfDNA from plasma with a typical input of 33 ng, the practical detection limit was ~10−4 or 0.01% mutant allele frequency (MAF). In 17 of 19 patients with identified hotspot mutations in tumor gDNA, at least one hotspot mutation could be detected in plasma DNA at the time of diagnosis. The MAF increased at subsequent time points in four of the patients who experienced a clinical relapse. Multiplex superRCA analysis of the remaining six patients did not reveal any hotspot mutations. In conclusion, multiplex superRCA assays proved suitable for monitoring CRC patients by analyzing hotspot mutations in cfDNA, and dynamic changes in MAF were observed in patients with clinical relapse.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- colorectal cancer
- recurrence
- cfDNA
- ctDNA
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
Cancers
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Sandberg, Emma
-
Nunes, Luís, 199 ...
-
Edqvist, Per-Hen ...
-
Mathot, Lucy
-
Chen, Lei, 1985-
-
Edgren, Tomas
-
visa fler...
-
Al Nassralla, Sh ...
-
Glimelius, Bengt
-
Landegren, Ulf
-
Sjöblom, Tobias
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Cancers
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet